广丰千金薯和铁棍山药脱毒微型块茎的转录组分析 |
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引用本文: | 尹明华,白丽,陈舒敏,程佳慧,冯丽文.广丰千金薯和铁棍山药脱毒微型块茎的转录组分析[J].浙江农业学报,2022,34(10):2209. |
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作者姓名: | 尹明华 白丽 陈舒敏 程佳慧 冯丽文 |
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作者单位: | 1.上饶师范学院 生命科学学院,江西 上饶 3340012.上饶农业技术创新研究院,江西 上饶 3340013.上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室,江西 上饶 3340014.上饶市薯芋类作物种质保存与利用重点实验室,江西 上饶 334001 |
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基金项目: | 2021年度江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ211729);上饶市科技局平台载体建设项目(2020I001) |
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摘 要: | 为探究广丰千金薯和铁棍山药在分子水平的差异,以广丰千金薯(QJS)和铁棍山药(TGSY)试管苗的微型块茎为试验材料进行转录组分析。结果表明:QJS组和TGSY组样本间相关系数为0.42。QJS组和TGSY组表达量FPKM的对数值在0~1.5,表达量密度在0~1.0。与TGSY组相比,QJS组有4 765个基因下调,有5 112个基因上调。QJS组和TGSY组表达的共有基因有25 207个,QJS组单独表达的基因有5 261个,TGSY组单独表达的基因有3 571个。QJS组和TGSY组共发现611 498个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点和12 056个简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)。与TGSY组相比,QJS组的淀粉合成酶3、α-淀粉酶3、β-淀粉酶、类黄酮3'-单加氧酶、类黄酮3'-羟化酶、花青素合酶等基因上调,而颗粒结合淀粉合酶2、蔗糖合酶1、扩展蛋白2和苯丙氨酸解氨酶等基因下调。这可能是广丰千金薯微型块茎肉质绵密粉嫩、软糯爽口、胁迫防御、食后易胀的内在原因。结果可以为广丰千金薯的品种鉴定和分子育种提供参考。
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关 键 词: | 广丰千金薯 铁棍山药 脱毒 微型块茎 转录组分析 |
收稿时间: | 2022-01-18 |
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