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Race法扩增4株鸭肝炎病毒3′末端序列及其克隆分析
引用本文:邵泽香,韦强,崔言顺,鲍国连,刘燕,季权安.Race法扩增4株鸭肝炎病毒3′末端序列及其克隆分析[J].浙江农业学报,2009,21(3).
作者姓名:邵泽香  韦强  崔言顺  鲍国连  刘燕  季权安
作者单位:1. 山东农业大学,动物科技学院,山东,泰安,271018;浙江省农业科学院,畜牧兽医研究所,浙江,杭州,310021
2. 浙江省农业科学院,畜牧兽医研究所,浙江,杭州,310021
3. 山东农业大学,动物科技学院,山东,泰安,271018
基金项目:浙江省重点科技攻关项目,浙江省自然科学基金 
摘    要:利用3′RACE方法扩增并克隆了4株鸭肝炎病毒(DHV)(ZYM株、Z05株、Z07株和Z10株)的基因组的3′末端真实序列,包括部分非结构蛋白(3D)基因以及紧接着3D基因下游的3′端非编码区(untranslated region,UTR)和poly(A)尾巴.测序结果表明,扩增的特异性片段长度为597 nt(不包括polyA尾巴).各毒株3′UTR均为315 nt,位于终止密码子TGA之后,比对分析结果表明各毒株间的同源性较高;4株DHV 3′末端核苷酸序列(不包括polyA尾巴)之间的同源性为96.3%~100%,而与参考毒株之间的同源性为93.5%~99.7%.在系统发生进化树上,各毒株亲缘关系较近.

关 键 词:3′RACE  鸭病毒性肝炎病毒  序列比对分析  3′端非编码区

Molecular cloning and analysis of the 3′end sequence of four strains of duck hepatitis virus by 3′RACE
SHAO Ze-xiang,WEI Qiang,CUI Yan-shun,BAO Guo-lian,LIU Yan,JI Qua-nan.Molecular cloning and analysis of the 3′end sequence of four strains of duck hepatitis virus by 3′RACE[J].Acta Agriculturae Zhejiangensis,2009,21(3).
Authors:SHAO Ze-xiang  WEI Qiang  CUI Yan-shun  BAO Guo-lian  LIU Yan  JI Qua-nan
Abstract:
Keywords:Poly(A)
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