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| 三角帆蚌细胞周期蛋白基因筛选及其表达分析 | |
| 引用本文： | 冯上乐,李雪男,陈一格,刘瑞琦,白志毅,李文娟.三角帆蚌细胞周期蛋白基因筛选及其表达分析[J].浙江农业学报,2021,33(11):2041. |
| 作者姓名： | 冯上乐 李雪男 陈一格 刘瑞琦 白志毅 李文娟 |
| 作者单位： | a.上海海洋大学 农业农村部淡水水产种质资源重点实验室,上海 201306b.上海海洋大学 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海 201306c.上海海洋大学 水产科学国家级实验教学示范中心,上海 201306 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金(31201991);国家重点研发计划(2018YFD0901406) |
| 摘 要： | 细胞周期蛋白(cyclin)对细胞生长繁殖起到关键的调节作用。该研究采用高通量测序技术,构建了三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)转录组文库,进行了cyclins基因筛选与生物信息分析,通过qRT-PCR技术,探讨其在不同组织(闭壳肌、内脏团、外套膜、斧足、心脏、血液、鳃、性腺)与性别中的表达特征。转录组测序共得到257 457条unigene(N50为1 796 bp),注释率为86.7%;通过分析,cyclin A、cyclin D2、cyclin E被筛选出,且cyclin A、cyclin D2与cyclin E蛋白的氨基酸序列均与美洲牡蛎(Crassostrea virginica)、太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)具有较高相似性。实时荧光定量分析结果表明,cyclin A、cyclin D2、cyclin E在三角帆蚌各组织中均有表达,且存在显著的组织差异:cyclin A、cyclin E基因在性腺中表达量显著高于其他组织(P<0.05),在斧足中表达量最低;cyclin D2基因在鳃中表达量最高(P<0.05),在血液中表达量最低。在同一组织的不同性别之间:cyclin A基因在性腺、闭壳肌、心脏、血液中表达存在显著性别差异(P<0.05);cyclin D2在外套膜、心脏、性腺中的表达具有显著(P<0.05)的性别差异;cyclin E在性腺、斧足、鳃、心脏中的表达具有显著(P<0.05)的性别差异;cyclin A、cyclin E基因在雌性心脏和性腺中表达量显著(P<0.05)高于雄性,而cyclin D2反之(P<0.05),cyclin D2基因在雌性外套膜表达量显著高于雄性(P<0.05),暗示cyclin A、cyclin E与性腺发育关系密切,cyclin D2可能与鳃损伤修复有关。本研究初步探究了三角帆蚌cyclin A、cyclin D2、cyclin E基因的功能,为建立三角帆蚌细胞系提供了分子基础。 |
| 关 键 词： | 转录组 三角帆蚌 细胞周期蛋白 组织表达谱 |
| 收稿时间： | 2021-01-16 |
Screening and expression of cyclins gene in Hyriopsis cumingii |
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| FENG Shangle,LI Xuenan,CHEN Yige,LIU Ruiqi,BAI Zhiyi,LI Wenjuan.Screening and expression of cyclins gene in Hyriopsis cumingii[J].Acta Agriculturae Zhejiangensis,2021,33(11):2041. | |
| Authors: | FENG Shangle LI Xuenan CHEN Yige LIU Ruiqi BAI Zhiyi LI Wenjuan |
| Institution: | a. Key Laboratory of Freshwater Aquatic Genetic Resources, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China b. Key Laboratory of Exploration and Utilization of Aquatic Genetic Resources, Ministry of Education, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China c. National Demonstration Center for Experimental Fisheries Science Education, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China |
| Abstract: | |
| Keywords: | |
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