| 萱草根茎低温胁迫转录组分析 |
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| 引用本文： | 黄长兵,程培蕾,杨绍宗,张焕朝,姜正之,金立敏.萱草根茎低温胁迫转录组分析[J].浙江农业学报,2021,33(8):1445. |
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| 作者姓名： | 黄长兵 程培蕾 杨绍宗 张焕朝 姜正之 金立敏 |
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| 作者单位： | 1.南京林业大学 南方现代林业协同创新中心/林学院,江苏 南京 2100372.苏州农业职业技术学院 园艺科技学院,江苏 苏州 2150083.苏州市华冠园创园艺科技有限公司,江苏 苏州 215557 |
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| 基金项目： | 江苏省高等学校自然科学研究(19KJB210017);苏州市科技计划(SNG2018053);江苏现代农业产业技术体系(JATS〔2018〕232) |
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| 摘 要： | 低温胁迫是萱草育种和生产中最严重的非生物胁迫之一。该研究以耐冷型和冷敏感型萱草低温处理前后的根茎为材料,利用转录组测序(RNA-seq)技术,比较了耐冷型和冷敏感型萱草在低温胁迫下的基因表达差异。结果表明,4个样品获得的高质量clean reads均大于35 880 734条;低温处理后,耐冷型萱草差异表达基因数量多于冷敏感型,差异表达基因主要富集于次级代谢产物等相关途径,Ca2+信号通路基因、MAPKs信号通路基因、转录因子和热激蛋白基因表达在2种萱草中表现出不同的变化,可能导致2种萱草在低温胁迫中的不同反应。qRT-PCR验证结果显示,差异基因的表达变化趋势与RNA-seq结果一致。该研究表明Ca2+信号通路基因、MAPKs信号通路基因在萱草响应低温胁迫过程中发挥着重要作用。
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| 关 键 词： | 萱草 转录组 差异表达基因 低温胁迫 |
| 收稿时间： | 2020-10-11 |
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