| 鸡传染性支气管炎病毒S1,M和N基因遗传变异相关性 |
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| 引用本文： | 亓丽红,艾武,黄兵,王莉莉,秦卓明,宋敏训.鸡传染性支气管炎病毒S1,M和N基因遗传变异相关性[J].浙江农业学报,2010,22(2). |
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| 作者姓名： | 亓丽红 艾武 黄兵 王莉莉 秦卓明 宋敏训 |
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| 作者单位： | 山东省农业科学院家禽研究所,山东济南,250023 |
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| 基金项目： | 国家科技支撑计划，山东省农业科学院创新基金 |
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| 摘 要： | 对山东省1992—2005年分离的鸡传染性支气管炎病毒(IBV)毒株的纤突蛋白(S1)、膜蛋白(M)和核衣壳蛋白(N)分别进行克隆测序,结合在GenBank中发表的其他具有S1,N和M基因的IBV参考序列,利用DNAStar软件和统计学软件SPSS8.0,对不同毒株的S1,N和M基因分别进行遗传变异和同源性相关分析。结果表明:不同毒株间S1基因与M基因核苷酸遗传变异的相关系数为0.483,S1基因与N基因核苷酸遗传变异的相关系数为0.570,M基因与N基因核苷酸遗传变异的相关系数为0.620,说明S1,M和N基因三者之间的遗传变异既有同步性又有独立性。通过S1,N基因推导的氨基酸系统进化树表明,9株山东野毒株具有较近的亲缘关系,变异方向一致,且与疫苗株的亲缘关系较远,但从M基因推导的氨基酸系统进化树分析,只有3株山东野毒株与部分疫苗株有一定的亲缘关系。由此表明,IBV存在基因重组现象。
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| 关 键 词： | 鸡传染性支气管炎病毒 S1基因 N基因 M基因 同源性 遗传变异 相关性 |
Avian infectious bronchitis virus heredity mutation and correlation analysis of S1,M and N gene |
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| QI Li-hong,AI Wu,HUANG Bing,WANG Li-li,QIN Zhuo-ming,SONG Min-xun.Avian infectious bronchitis virus heredity mutation and correlation analysis of S1,M and N gene[J].Acta Agriculturae Zhejiangensis,2010,22(2). |
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| Authors: | QI Li-hong AI Wu HUANG Bing WANG Li-li QIN Zhuo-ming SONG Min-xun |
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| Institution: | QI Li-hong,AI Wu,HUANG Bing,WANG Li-li,QIN Zhuo-ming,SONG Min-xun* (Institute of Poultry Science,Sh,ong Academy of Agricultural Science,Jinan 250023,China) |
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| Abstract: | Avian infectious bronchitis virus strains that prevailed in 1992-2005 in Shandong Province were collected.The spike protein (S1) gene,matrix (M) protein gene and nucleocapsid (N) gene of these virus were cloned and sequenced.The sequences of S1 gene,M gene and N gene published in GenBank were also collected.The homologies and correlations in nucleotide and amino acid of S1 gene,M gene and N gene were compared and analyzed by DNAStar and SPSS 8.0 software.The results showed the correlation coefficient of nuc... |
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| Keywords: | avian infectious bronchitis virus S1 gene N gene M gene nucleotide homology heredity mutation correlation |
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