| 圆白鲳消化道菌群PCR-DGGE基因指纹图谱构建 |
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| 引用本文： | 周志刚,石鹏君,姚斌,何夙旭.圆白鲳消化道菌群PCR-DGGE基因指纹图谱构建[J].上海水产大学学报,2008,17(2):140-144. |
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| 作者姓名： | 周志刚 石鹏君 姚斌 何夙旭 |
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| 作者单位： | 周志刚（中国农业科学院饲料研究所,北京,100081）;石鹏君（中国农业科学院饲料研究所,北京,100081）;姚斌（中国农业科学院饲料研究所,北京,100081）;何夙旭（中国农业科学院饲料研究所,北京,100081） |
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| 基金项目： | 国际科技合作项目
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中国博士后科学基金
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国家重点实验室基金
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广东省自然科学基金 |
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| 摘 要： | 采取免培养的16S rDNA梯度凝胶电泳(DGGE)技术对集约化海水网箱养殖圆白鲳Ephippus orbis(体重17.7±3.0 g)包括胃壁、胃内容物、肠壁及肠内容物在内的消化道菌群结构进行了初步分析.DGGE指纹图谱显示圆白鲳胃内容物、胃壁及肠壁有7条明显条带,肠内容物有6条明显条带,提示圆白鲳消化道可能存在着较丰富细菌群落;针对指纹图谱的聚类分析表明胃内容物及肠内容物细菌组成相似度最高达90.0%,而胃壁与肠壁的相似度相对较差达80%.半定量分析表明圆白鲳消化道菌群相对丰度的变异系数均大于47.4%,暗示圆白鲳消化道趋向于以一种或极少数种细菌占统治地位.
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| 关 键 词： | 圆白鲳 16S rDNA DGGE指纹图谱 白鲳 消化道菌群 基因指纹图谱 bacterial community gastrointestinal fingerprint gene 统治地位 细菌组成 变异系数 相对丰度 半定量 相似度 分析表 聚类 细菌群落 存在 显示 菌群结构 肠内容物 |
| 文章编号： | 1004-7271(2008)02-0140-05 |
| 修稿时间： | 2007年7月16日 |
Construction of PCR-DGGE gene fingerprint for the gastrointestinal bacterial community in Ephippus orbis |
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| ZHOU Zhi-gang,SHI Peng-jun,YAO Bing,HE Su-xu.Construction of PCR-DGGE gene fingerprint for the gastrointestinal bacterial community in Ephippus orbis[J].Journal of Shanghai Fisheries University,2008,17(2):140-144. |
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| Authors: | ZHOU Zhi-gang SHI Peng-jun YAO Bing HE Su-xu |
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