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利用PCR-DGGE法分析暗纹东方鲀的弧菌菌落组成
引用本文:杨桂梅,唐文乔,李会荣,黄路标,任大明,鲍宝龙.利用PCR-DGGE法分析暗纹东方鲀的弧菌菌落组成[J].上海水产大学学报,2006,15(3):257-263.
作者姓名:杨桂梅  唐文乔  李会荣  黄路标  任大明  鲍宝龙
作者单位:上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室 上海200090(杨桂梅,唐文乔,鲍宝龙),中国极地研究中心国家海洋局极地科学重点实验室 上海200136(李会荣),复旦大学遗传学研究所遗传工程国家重点实验室 上海200433(黄路标,任大明)
基金项目:上海市教委资助项目;引进国际先进农业科技计划(948计划)
摘    要:采用16S rDNA特征序列PCR-DGGE法,分析了不同饵料饲养的暗纹东方的表皮、性腺和肠道中,以弧菌为主的细菌群落的组成。结果表明:(1)共鉴定出暗纹东方体内18种微生物,均归属于变形细菌的gamma亚群,其中13种为弧菌科细菌,3种为肠杆菌科细菌,2种为气单胞菌属细菌;(2)投喂鲜活鱼虾的与投喂人工配合饲料的暗纹东方肠道和性腺中的细菌组成是不同的,在性腺中分离到的所有12种细菌中,只有2种细菌是相同的,约占17%;在肠道中分离到的所有13种细菌中,有4种是相同的,约占31%。而在表皮上所分离到的11种细菌中,有7种细菌是相同的,约占64%;(3)DGGE特征条带V1、V13、V18、V14和V17所代表的细菌只在表皮组织被分离到,V6所代表的细菌仅出现在以鲜活鱼虾作为饵料的暗纹东方性腺中,V5所代表的细菌仅出现在以鲜活鱼虾作为饵料的暗纹东方肠道中;(4)DGGE特征条带V5、V8、V13、V18、V6、V14和V17所代表的细菌不能在TCBS培养基上培养,占18种被鉴定的细菌总数的39%。

关 键 词:暗纹东方鲀  弧菌  变性梯度凝胶电泳  细菌群落
文章编号:1004-7271(2006)03-0257-07
收稿时间:2006-02-26
修稿时间:2006年2月26日

Analysis on Vibrio bacterial flora in Takifugu obscurus by PCR-DGGE
YANG Gui-mei,TANG Wen-qiao,LI Hui-rong,HUANG Lu-biao,REN Da-ming,BAO Bao-long.Analysis on Vibrio bacterial flora in Takifugu obscurus by PCR-DGGE[J].Journal of Shanghai Fisheries University,2006,15(3):257-263.
Authors:YANG Gui-mei  TANG Wen-qiao  LI Hui-rong  HUANG Lu-biao  REN Da-ming  BAO Bao-long
Institution:1. Key laboratory of Aquatic Genetic Resources and Aquacultural Ecology Certificated by Ministry of Agriculture, Shanghai Fisheries University, Shanghai 200090, China; 2. SOA Key laboratory for Polar Science, Polar Research Institute of China, Shanghai 200136, China; 3. State Key Laboratory of Genetic Engineering, Fudan University, Shanghai 200433, China
Abstract:
Keywords:16S rDNA
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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