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栗疫菌CpIAP基因生物信息学分析及功能研究
引用本文:高坤,张林巧,熊琴,王奎杰,徐晶,王克荣.栗疫菌CpIAP基因生物信息学分析及功能研究[J].南京农业大学学报,2011,34(6).
作者姓名:高坤  张林巧  熊琴  王奎杰  徐晶  王克荣
作者单位:南京农业大学农作物生物灾害综合治理教育部重点实验室,江苏南京,210095
基金项目:国家转基因生物新品种培育重大专项
摘    要:寻找栗疫菌的凋亡抑制蛋白( inhibitor of apoptosis proteins,IAPs)类蛋白,明确该蛋白与其他物种IAPs的进化关系,并对CpIAP基因功能进行初步研究.以IAPs家族的典型结构域“BIR”为靶标,对栗疫菌基因组数据库进行BLAST搜索.运用生物信息学对预测的CpIAP蛋白结构进行分析并构建系统进化树;采用同源重组的策略,构建CpIAP基因缺失突变体,并重新导入该基因全长片段获得互补株.结果从栗疫菌中鉴定了1个IAP基因,Southern blot验证为单拷贝.生物信息学分析表明:CpIAP基因全长2 997 bp,编码920个氨基酸,具有2个BIR结构域;进化关系上CpIAP与人Survivin和酵母IAP较近.CpIAP敲除突变体命名为△IAP,△IAP菌落形态改变,生长速率减慢,致病力下降,丧失产孢能力.上述结果表明:CpIAP参与了栗疫菌的菌落形态建成、分生孢子形成和致病过程.

关 键 词:栗疫菌  凋亡抑制蛋白(IAPs)  致病性  产孢能力

Bioinformatics analysis of inhibitor of apotosis protein(IAP) and functional characterization in Cryphonectria parasitica
GAO Kun,ZHANG Lin-qiao,XIONG Qin,WANG Kui-jie,XU Jing,WANG Ke-rong.Bioinformatics analysis of inhibitor of apotosis protein(IAP) and functional characterization in Cryphonectria parasitica[J].Journal of Nanjing Agricultural University,2011,34(6).
Authors:GAO Kun  ZHANG Lin-qiao  XIONG Qin  WANG Kui-jie  XU Jing  WANG Ke-rong
Abstract:
Keywords:
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