| 高等植物液泡加工酶VPE家族的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 修林春,张炜.高等植物液泡加工酶VPE家族的生物信息学分析[J].南京农业大学学报,2010,33(3). |
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| 作者姓名： | 修林春 张炜 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，国家863计划项目 |
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| 摘 要： | 利用已经分离的植物液泡加工酶(vacuolar processing enzyme,VPE)蛋白家族的Peptidase_C13结构域序列为检索序列,对拟南芥和水稻中的VPE家族成员进行序列分析,同时利用所有成员的氨基酸序列构建系统进化树,并对其中的保守序列以及信号肽区段和亚细胞定位进行了分析.结果表明:1)结合同源序列的搜索和结构域的鉴定,最终在拟南芥和水稻中确定了8个和13个VPE,其中2个拟南芥和11个水稻VPE成员为首次报道;2)蛋白系统进化分析表明,该基因家族的基本特征在拟南芥和水稻分离之前就已经形成;3)多序列联配以及MEME分析表明,Peptidase_C13结构域在VPE家族成员间高度保守;4)亚细胞定位分析表明,VPE成员定位于细胞中的不同特定位置,定位于液泡中的占多数.
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| 关 键 词： | 拟南芥 水稻 液泡加工酶 细胞程序性死亡(PCD) 生物信息学 |
Bioinformatic analysis Of VPE family in higher plants |
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| XIU Lin-chun,ZHANG Wei.Bioinformatic analysis Of VPE family in higher plants[J].Journal of Nanjing Agricultural University,2010,33(3). |
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| Authors: | XIU Lin-chun ZHANG Wei |
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