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茶树紫黄素脱环氧化酶基因的cDNA克隆及其生物信息学分析
引用本文:韦朝领,江昌俊,陶汉之,宛晓春.茶树紫黄素脱环氧化酶基因的cDNA克隆及其生物信息学分析[J].南京农业大学学报,2003,26(1):14-19.
作者姓名:韦朝领  江昌俊  陶汉之  宛晓春
作者单位:安徽农业大学农业部茶叶生物技术重点开放实验室,安徽,合肥,230036
基金项目:农业部农业结构调整重大技术研究专项 ( 2 0 0 2 12 0 2A),安徽省教育厅自然基金资助项目 ( 2 0 0 0JL0 67)
摘    要:根据GenBank中已登录的植物紫黄素脱环氧化酶(VDE)基因序列,以其高度保守的氨基酸序列设计一对简并引物,采用RT-PCR与3′/5′-RACE相结合的方法,从茶树(Camellia sinensi)中克隆出VDE的全长cDNA,长度为1632bp,分析表明,该序列的5′-端和3′-端的非编码序列长度分别为61bp和140bp,开放阅读框为1422bp,编码473个氨基酸。其转运肽长度为132个氨基酸。成熟蛋白的氨基酸序列与拟南芥,莴苣,菠菜及烟草的同源性分别为83.5%。82.7%,82.1%和83.6%。且有3个特殊的结构域;半胱氨酸富集区,脂肪结合蛋白特征区和由谷氨酸富集的高电荷区,分析表明,茶树VDE具有热稳定性。

关 键 词:茶树  紫黄素  脱环氧化酶  基因  cDNA克隆  生物信息学
文章编号:1000-2030(2003)01-0014-06
修稿时间:2002年9月13日

Cloning and bioinformatics analysis of sequence signature of violaxanthin de-epoxidase cDNA in tea plant (Camellia sinensis (L.) O.Kuntzes)
WEI Chao ling,JIANG Chang jun ,TAO Han zhi,WAN Xiao chun.Cloning and bioinformatics analysis of sequence signature of violaxanthin de-epoxidase cDNA in tea plant (Camellia sinensis (L.) O.Kuntzes)[J].Journal of Nanjing Agricultural University,2003,26(1):14-19.
Authors:WEI Chao ling  JIANG Chang jun  TAO Han zhi  WAN Xiao chun
Institution:WEI Chao ling,JIANG Chang jun *,TAO Han zhi,WAN Xiao chun
Abstract:
Keywords:cDNA
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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