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CIDEA基因上游调控区变异对猪肌内脂肪性状的影响
引用本文:杨凯,魏雨辰,吴望军,钮莹芳,邱启勇,邵勇钢,翟曼君,董新星,韦伟,陈杰,张立凡.CIDEA基因上游调控区变异对猪肌内脂肪性状的影响[J].南京农业大学学报,2022(3):570-577.
作者姓名:杨凯  魏雨辰  吴望军  钮莹芳  邱启勇  邵勇钢  翟曼君  董新星  韦伟  陈杰  张立凡
作者单位:1. 南京农业大学动物科技学院;2. 新疆农业大学动物科学学院;3. 云南农业大学动物科学技术学院
基金项目:中央高校基本科研业务费专项资金(KYYJ202008);;国家转基因生物新品种培育重大专项(2018ZX0800928B);;国家科技支撑计划项目(2015BAD03B01);
摘    要:目的]本文旨在鉴定诱导细胞死亡DNA片段化因子α样效应因子A(CIDEA)基因上游调控区内与猪肌内脂肪沉积相关的单核苷酸多态性(SNP)位点,并分析关联位点对基因表达的影响,为解析CIDEA基因对猪肌内脂肪性状的影响机制提供参考。方法]通过对猪CIDEA上游调控区2 kb片段测序,挖掘出肌内脂肪含量相关的候选SNP位点,在杜洛克×长白猪×大白猪群体中对候选位点进行关联分析;通过荧光定量PCR检测关联位点不同基因型个体的CIDEA基因表达量和肌内脂肪标记基因脂肪酸结合蛋白4基因(FABP4)、脂肪酸结合蛋白3基因(FABP3)的表达量;双荧光素酶报告基因系统分析突变位点对CIDEA基因转录活性的影响。结果]猪CIDEA基因上游调控区包含6个SNP位点,连锁分析后选择g.97268816 T>A、g.97269217 G>A和g.97269353 C>T 3个标签SNP位点进行关联分析,发现g.97268816 T>A位点中AA基因型个体的肌内脂肪含量显著高于TT基因型个体(P<0.05),而g.97269217 G>A和g.97269353 C&...

关 键 词:CIDEA    肌内脂肪  变异  转录活性
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