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培矮64S/93-11重组自交系分子图谱构建及千粒重QTL检测
引用本文:徐小飒,刘喜,赵志刚,周裕军,吴盛阳,周蓉,张俊杰,江玲,万建民.培矮64S/93-11重组自交系分子图谱构建及千粒重QTL检测[J].南京农业大学学报,2011,34(1).
作者姓名:徐小飒  刘喜  赵志刚  周裕军  吴盛阳  周蓉  张俊杰  江玲  万建民
作者单位:1. 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/江苏省植物基因工程技术研究中心,江苏,南京,210095
2. 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/江苏省植物基因工程技术研究中心,江苏,南京,210095;中国农业科学院作物科学研究所,北京,100081
基金项目:国家863计划项目(2009AA101101,2007AA10Z116); 国家科技支撑计划项目(2006BAD01A01); 江苏省高技术招标项目(BE2009301-3,BE2008354,BE2008352); 南京农业大学SRT计划项目(0801A27)
摘    要:利用光、温敏核不育系培矮64S与常规品种93-11进行杂交,以单粒传方法建立含217个单株的重组自交系(R ILs)群体。选用775对SSR引物进行亲本多态性筛选,共有170对检测到多态性,频率为21.9%。构建的水稻分子遗传图谱共包含141个标记座位,总图距约2 060.4 cM,标记间平均图距为14.6 cM。群体中标记偏分离情况较严重。以该R ILs群体217个株系为材料,对千粒重性状进行了QTL分析。结果表明:在R ILs群体中检测到3个与千粒重相关的QTL,分别在第1、5、8染色体上,命名为qTGW-1、qTGW-5、qTGW-8,其LOD值为5.51、3.31、4.94,贡献率为17.90%、6.12%、9.59%。qTGW-1控制千粒重的增效基因来自低值亲本培矮64S,qTGW-5和qTGW-8控制千粒重的增效基因来自高值亲本93-11。通过相应的含有154个家系的全基因组染色体片段置换系(CSSLs)群体图示基因型分析,证实了在第1染色体上标记RM315附近存在控制千粒重的增效基因,来源于染色体片段供体亲本培矮64S,使千粒重增加1.03 g;在第5、8染色体上标记RM3663、RM310附近...

关 键 词:水稻  重组自交系  SSR  分子标记  遗传连锁图谱  千粒重  染色体片段置换系  QTL  

Construction of genetic linkage map based on a RILs population derived from the hybrid rice Peiai 64S/93-11 and detection of QTL for 1 000-grain weight
XU Xiao-sa,LIU Xi,ZHAO Zhi-gang,ZHOU Yu-jun,WU Sheng-yang,ZHOU Rong,ZHANG Jun-jie,JIANG Ling,WAN Jian-min.Construction of genetic linkage map based on a RILs population derived from the hybrid rice Peiai 64S/93-11 and detection of QTL for 1 000-grain weight[J].Journal of Nanjing Agricultural University,2011,34(1).
Authors:XU Xiao-sa  LIU Xi  ZHAO Zhi-gang  ZHOU Yu-jun  WU Sheng-yang  ZHOU Rong  ZHANG Jun-jie  JIANG Ling  WAN Jian-min
Institution:XU Xiao-sa1,LIU Xi1,ZHAO Zhi-gang1,ZHOU Yu-jun1,WU Sheng-yang1,ZHOU Rong1,ZHANG Jun-jie1,JIANG Ling1,WAN Jian-min1,2(1.State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement/Research Center of Jiangsu Plant GeneEngineering,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China,2.Institute of Crop Sciences,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081,China)
Abstract:The present study used the photo-thermo sensitive genic male sterile Peiai 64S and 93-11 as the material to develop 217 recombinant inbred lines(RILs)by using SSR marker aided selection.A total of 775 pairs of SSR markers were used to analyze the polymorphism between Peiai 64S and 93-11.It was shown that there were 170 pairs of polymorphism markers and their polymorphic ratio are 21.9%.The linkage map consists of 141 SSR markers.This map covered the rice genome about 2 060.4 cM with about 14.6 cM of average...
Keywords:rice  RILs  SSR  molecular marker  genetic linkage map  1 000-grain weight  CSSLs  QTL  
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