蓖麻赤霉素氧化酶基因的全基因组鉴定和表达分析

赤霉素氧化酶基因(GAox)是赤霉素合成和调控的关键酶，其通过调节植物活性GA水平调控植物株高。为了解析蓖麻赤霉素氧化酶基因(RcGAox),利用生物信息学分析方法对RcGAox进行全基因组鉴定，并分析其理化性质、保守结构域、系统发育、基因上游2 kb启动子区域顺式作用元件预测，通过蓖麻表达数据库以及外源赤霉素和多效唑处理2个蓖麻品种的顶端嫩茎转录组测序分析RcGAox基因表达模式。结果表明：蓖麻共有30个赤霉素氧化酶基因，其中7个RcGA2ox、4个RcGA3ox、19个RcGA20ox,蛋白质分子质量在26.12～44.31 ku,等电点预测值在5.06～7.82,内含子个数为1～2个；蛋白结构域分析保守基序Motif 1、Motif 2、Motif 4存在30条蛋白序列中；系统进化分析将RcGAox基因分为5个不同的亚群：Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和C20 GA2ox,其中Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ分别对应GA2ox、GA3ox、GA20ox;启动子顺式作用元件预测光反应相关的顺式元件数量最多，且在预测区域均匀分布，18个基因含1～2个赤霉素相关元件；蓖麻RcGAox在胚乳、雄花、叶片中特异表达的基因分别有...