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抗(感)赤霉病谷子品种内生菌多样性分析
引用本文:毛亚楠,田菲菲,刘婷婷,韩欣芃,郝志敏,李志勇.抗(感)赤霉病谷子品种内生菌多样性分析[J].华北农学报,2024(1):175-183.
作者姓名:毛亚楠  田菲菲  刘婷婷  韩欣芃  郝志敏  李志勇
作者单位:1. 河北省农林科学院谷子研究所,农业农村部特色杂粮遗传改良与利用重点实验室(部省共建),河北省杂粮研究重点实验室;2. 河北省农业微生物生物信息技术创新中心,河北农业大学生命科学学院
基金项目:河北省农林科学院基本业务费(2021030201);
摘    要:旨为揭示不同品种以及不同器官中内生菌的多样性特征,初步明确内生菌群落结构与宿主品种、器官类型及病害抗感特性的相关性。选取抗赤霉病的冀谷22、红谷、陇谷11号和感赤霉病的小青谷、石榴子、嫩选16号共6个谷子品种,取其根、茎、叶片、叶鞘、成熟谷穗,提取DNA,针对16S rDNA V3—V4区域,进行PCR扩增,基于Miseq高通量测序平台,对样本进行微生物多样性分析。感病品种与抗病品种内生菌物种组成具有明显差异。供试样本在门水平上的优势种群为变形菌门和放线菌门,其次是拟杆菌门和厚壁菌门,粘菌门、绿弯菌门、芽单胞菌门和梭杆菌门相对丰度较低。Alpha多样性分析表明,抗病品种的叶片、成熟谷穗群落丰富度较高,叶片、根、成熟谷穗多样性较高;而感病品种则是根和茎群落丰富度较高,茎和叶鞘多样性相对较高;PCoA分析则表明,器官类型比品种对内生菌群落结构影响更大。物种组成分析表明,谷子内生菌群的多样性受到不同品种及不同器官的影响,不同器官所含内生菌种类相差较大。感病品种小青谷、石榴子和嫩选16与抗病品种冀谷22、红谷和陇谷11的内生菌群多样性差异较大,抗病品种在叶鞘时期都具有NB1-j菌门,成熟谷穗都...

关 键 词:谷子  谷子赤霉病  内生菌  多样性
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