高通量测序技术对早熟棉中miRNA的鉴定与分析 |
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引用本文: | 董章辉,朱青竹,赵丽芬,眭书祥,李增书,张艳丽,王虎,郭永召,姚则羊,赵国忠.高通量测序技术对早熟棉中miRNA的鉴定与分析[J].华北农学报,2019,34(z1). |
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作者姓名: | 董章辉 朱青竹 赵丽芬 眭书祥 李增书 张艳丽 王虎 郭永召 姚则羊 赵国忠 |
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作者单位: | 石家庄市农林科学研究院,河北 石家庄 050041;石家庄市农林科学研究院,河北 石家庄 050041;石家庄市农林科学研究院,河北 石家庄 050041;石家庄市农林科学研究院,河北 石家庄 050041;石家庄市农林科学研究院,河北 石家庄 050041;石家庄市农林科学研究院,河北 石家庄 050041;石家庄市农林科学研究院,河北 石家庄 050041;石家庄市农林科学研究院,河北 石家庄 050041;石家庄市农林科学研究院,河北 石家庄 050041;石家庄市农林科学研究院,河北 石家庄 050041 |
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基金项目: | 国家棉花产业技术体系;河北省科技计划项目;河北省现代农业产业技术体系 |
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摘 要: | 棉花中miRNA的数量仍较少,miRNA在棉花早熟发育中的作用有待证明和揭示。为丰富棉花中miRNA的数量,同时,为揭示miRNA在早熟棉发育中的作用,以早熟棉花品种石早1和中熟棉花品种冀棉958为材料,利用高通量测序技术构建了2个小RNA文库,鉴定新的miRNA,比较早熟棉花和中熟棉花中miRNA表达的差异、特点。结果共鉴定到131个miRNA,包括41个不同家族的64个已知miRNA和67个新的miRNA;新miRNA中,54个miRNA属于已知miRNA家族,13个miRNA属于新的miRNA家族。比较2个品种中miRNA表达的差异,共发现39个miRNA在2个品种中的表达差异超过2倍,占总miRNA数的29. 8%,主要为中低量表达的miRNA。15个高表达miRNA中,只有miR398家族的ghr_21在2个品种中的表达差异超过2倍(达到3. 4倍);比较相同家族的不同miRNA在两品种中的表达差异,发现相同家族的miRNA在2个品种中表达差异可以不同,推测有不同的生物学功能。揭示了miRNA在早熟棉发育过程中,对其早熟性具有重要作用,为进一步研究miRNA在棉花早熟性调控中的作用提供依据。
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关 键 词: | 棉花 miRNA 高通量测序 早熟 |
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