| 利用高通量测序快速定位目标性状位点的研究 |
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| 引用本文： | 林静,赵青松,张孟臣,杨春燕,赵团结.利用高通量测序快速定位目标性状位点的研究[J].华北农学报,2019,34(6). |
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| 作者姓名： | 林静 赵青松 张孟臣 杨春燕 赵团结 |
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| 作者单位： | 河北省农林科学院 粮油作物研究所,国家大豆改良中心石家庄分中心,农业部黄淮海大豆生物学与遗传育种重点实验室,河北省农作物遗传育种重点实验室,河北 石家庄 050035;南京农业大学国家大豆改良中心,农业部大豆生物学与遗传育种重点实验室(综合),国家作物遗传与种质资源重点实验室,江苏 南京 210095;河北省农林科学院 粮油作物研究所,国家大豆改良中心石家庄分中心,农业部黄淮海大豆生物学与遗传育种重点实验室,河北省农作物遗传育种重点实验室,河北 石家庄 050035;南京农业大学国家大豆改良中心,农业部大豆生物学与遗传育种重点实验室(综合),国家作物遗传与种质资源重点实验室,江苏 南京 210095 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划（863计划）;国家产业技术体系;农业科技创新工程项目 |
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| 摘 要： | 为了快速鉴定目标性状遗传位点,开发与性状连锁的分子标记,用于剔除高世代选育株行中不利性状,从而加速育种进程。以大豆MS轮回群体中发生花色分离的F_6株行为研究材料,利用其衍生的F_(6∶7)中20个紫花和17个白花纯合家系分别构建2个DNA混池,通过高通量重测序技术获得变异信息,明确SNP富集区,并在SNP富集区内开发分子标记对目标性状进行连锁分析。结果显示,在2个DNA混池间发现329 992个SNP位点,表明混池间的遗传背景已经非常相似,但未发现明显SNP富集区,表明可能存在较多假阳性位点;进一步对高质量(Quality100)的SNP变异位点进行筛选,并去除杂合SNP位点,最终获得3 371个可信位点。其中,位于13号染色上的SNP变异有700个(占比20.77%),并在20～30 Mb的物理区间形成一个最大的SNP富集区,推测调控花色的W1位点可能位于此区间内。利用该区间内SNP信息开发出dCAPS-1、dCAPS-2分子标记,连锁分析结果显示其与W1位点紧密连锁(W1-(0.4 cM)-dCAPS-1-(2.3 cM)-dCAPS-2),表明W1位点位于SNP富集区内。综上所述,通过构建高世代株行的分离群体混池,利用高通量测序方法可以快速定位控制目标性状的遗传位点,且开发的dCAPS标记可以有效剔除不利性状,从而加速遗传育种进程。
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| 关 键 词： | 高世代混池 高通量测序 SNP变异 遗传定位 分子标记开发 |
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