| 玉米大斑病菌交配型基因克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 刘微微,郭丽婕,贾慧,曹志艳,高瑞萍,韩建民,董金皋.玉米大斑病菌交配型基因克隆及生物信息学分析[J].华北农学报,2014(5). |
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| 作者姓名： | 刘微微 郭丽婕 贾慧 曹志艳 高瑞萍 韩建民 董金皋 |
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| 作者单位： | 河北农业大学 真菌毒素与分子植物病理学实验室,河北 保定,071001 |
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| 基金项目： | 现代农业产业技术体系专项资金项目 |
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| 摘 要： | 以真菌毒素与分子植物病理学实验室前期分离、鉴定并保存的玉米大斑病菌菌株F 1-40（A交配型菌株）、01-23（a交配型菌株）为试验材料，利用候选基因法，通过PCR扩增和Genome Walking 技术，对A交配型菌株和a 交配型菌株的MAT基因进行同源片段扩增，从而获得基因全长及其侧翼序列，进一步利用生物信息学方法对扩增得到的MAT基因全长进行保守结构域分析，利用玉米大斑病菌基因组数据库的Blast序列比对软件将MAT1基因和MAT2基因的侧翼序列进行比对。研究结果表明，在不同交配型的玉米大斑病菌中，A交配型的菌株中含有A交配型基因MAT1，a交配型菌株中含有a交配型基因MAT2。2个基因均含有1个内含子，其中MAT1基因编码包括1个完整的MAT-α结合域，该结合域属于MAT alpha1家族。 MAT2基因编码包含1个完整的HMG-box结合域，该结合域属于DNA结合蛋白中HMG-box家族的Ⅰ类成员，由3个螺旋结构组成，位于133～202个氨基酸残基之间，整体呈U型，结构比较松散，通过高度序列特异性与DNA的小沟结合，参与DNA的复制、转录、翻译等一系列的过程，从而参与玉米大斑病菌的有性生殖过程。 MAT1基因和MAT2基因侧翼序列的相似性高于93％。
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| 关 键 词： | 玉米大斑病菌 交配型 基因克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of MAT G enes in Setosphaeria turcica |
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| LIU Wei-wei,GUO Li-jie,JIA Hui,CAO Zhi-yan,GAO Rui-ping,HAN Jian-min,DONG Jin-gao.Cloning and Bioinformatics Analysis of MAT G enes in Setosphaeria turcica[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2014(5). |
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| Authors: | LIU Wei-wei GUO Li-jie JIA Hui CAO Zhi-yan GAO Rui-ping HAN Jian-min DONG Jin-gao |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Setosphaeria turcica Mating-type Gene clone Bioinformatics analysis |
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