| 辣椒抗坏血酸生物合成酶GME基因家族的鉴定和表达分析 |
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| 引用本文： | 罗建,张国斌,车旭升,秦启杰.辣椒抗坏血酸生物合成酶GME基因家族的鉴定和表达分析[J].华北农学报,2020,35(4):71-78. |
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| 作者姓名： | 罗建 张国斌 车旭升 秦启杰 |
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| 作者单位： | 甘肃农业大学 园艺学院,甘肃 兰州 730070,甘肃农业大学 园艺学院,甘肃 兰州 730070,甘肃农业大学 园艺学院,甘肃 兰州 730070,甘肃农业大学 园艺学院,甘肃 兰州 730070 |
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| 基金项目： | 甘肃省科技重大专项计划;甘肃省自然科学基金 |
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| 摘 要： | GDP-甘露糖-3′,5′-异构酶基因(GME)是抗坏血酸途径中的关键限速酶,该基因可以调节AsA合成。为了解辣椒中GME基因家族功能及在非生物胁迫下的表达情况,通过生物信息学方法对辣椒GME基因家族进行鉴定,并对基因结构、结构域、系统进化关系、基因表达模式和非生物胁迫表达情况进行分析。结果表明,在辣椒中有2个GME家族成员,CaGME1和CaGME2,分别分布在3号和8号染色体上,都有6个外显子;CaGME1和CaGME2蛋白均具有NADB Rossmann家族中高度保守的NADPH结合位点、底物特异性结合位点,均不具有信号肽,为亲水性蛋白,定位在细胞质粒的可能性最高,均不具有跨膜结构,二级结构主要以不规则卷曲和α-螺旋为主;系统进化树分析表明,该基因编码的氨基酸序列与番茄和马铃薯的亲缘关系最近;qRT-PCR分析结果表明,在低温、茉莉酸甲酯和盐胁迫下CaGME1和CaGME2均被诱导上调,在赤霉素下均被诱导下调。综上可知,CaGME1和CaGME2基因在胁迫下不同的表达情况表明其在非生物胁迫中发挥作用,可为辣椒逆境胁迫机制研究提供参考。
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| 关 键 词： | 辣椒 抗坏血酸 GME基因家族 表达分析 |
Bioinformation Analysis and Expression Analysis of GME Genes
Family in Ascorbic Acid Biosynthesis of Pepper |
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| LUO Jian,ZHANG Guobin,CHE Xusheng,QIN Qijie.Bioinformation Analysis and Expression Analysis of GME Genes
Family in Ascorbic Acid Biosynthesis of Pepper[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2020,35(4):71-78. |
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| Authors: | LUO Jian ZHANG Guobin CHE Xusheng QIN Qijie |
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