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棉花纤维发育相关基因表达谱的比较分析
引用本文:李龙云,于霁雯,翟红红,黄双领,李兴丽,张红卫,张金发,喻树迅.棉花纤维发育相关基因表达谱的比较分析[J].分子植物育种,2010,8(3).
作者姓名:李龙云  于霁雯  翟红红  黄双领  李兴丽  张红卫  张金发  喻树迅
作者单位:1. 西北农林科技大学农学院,杨凌,712100;中国农业科学院棉花研究所,安阳,455000
2. 中国农业科学院棉花研究所,安阳,455000
3. 美国新墨西哥州立大学植物与环境科学部,新墨西哥州,30003,美国
摘    要:本研究通过3年4环境的田间试验,在BIL(backcross inbred lines)群体中选取断裂比强度最大的材料NMGA-062(32.5cN/tex)和断裂比强度最小的材料NMGA-144(26.67cN/tex),利用Affymetrix棉花基因芯片,比较分析NMGA-062和NMGA-144纤维发育10d时的基因表达谱。在24029条转录本中,两个基因型中差异表达的转录本6504条,占筛选转录本总数的27.07%;其中差异表达倍数在2倍或2倍以上的转录本有3461条,占筛选转录本总数的14.41%,对其进行功能分类。对8个差异表达明显的基因(Ghi.10655.1.S1_s_at,ACO1,ARF1,SAHH,TUA6,TUA7,β-tub1,β-tub10)进行实时荧光定量PCR的检测,发现表达模式均与芯片结果一致,说明芯片数据具有生物学意义上的可重复性,结果是可信的。本研究为以后克隆及功能验证纤维发育相关基因提供了重要参考。

关 键 词:棉花  基因芯片  差异表达基因  实时荧光定量PCR

Comparative Analysis of Cotton Fiber Development Related Gene Expression Profiling
Li Longyun,Yu Jiwen,Zhai Honghong,Huang Shuangling,Li Xingli,Zhang Hongwei,Zhang Jinfa,Yu Shuxun.Comparative Analysis of Cotton Fiber Development Related Gene Expression Profiling[J].Molecular Plant Breeding,2010,8(3).
Authors:Li Longyun  Yu Jiwen  Zhai Honghong  Huang Shuangling  Li Xingli  Zhang Hongwei  Zhang Jinfa  Yu Shuxun
Abstract:
Keywords:
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