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温州蜜柑CYVCV的CP基因克隆和序列分析
引用本文:张晓媛,杨杰,胡文娟,吴巧玲,李兴涛,佟晓楠.温州蜜柑CYVCV的CP基因克隆和序列分析[J].分子植物育种,2021,19(21):7048-7054.
作者姓名:张晓媛  杨杰  胡文娟  吴巧玲  李兴涛  佟晓楠
作者单位:赣南师范大学生命科学学院,国家脐橙工程技术研究中心,赣州,341000
摘    要:柑橘黄化脉明病(citrus yellow vein clearing,CYVCD)是一种危害柑橘的病毒病,克隆分析病原物序列信息对研发高灵敏检测方法具有重要意义.本研究从寻乌县温州蜜柑寄主上获得包含CYVCV的提取物,克隆CYVCV外壳蛋白(coat protein,CP)基因进行扩增测序和生物信息学分析.结果 表明,温州蜜柑叶片的CYVCV分离物的CP基因全长978 bp,编码325 aa,温州蜜柑CYVCV的CP基因序列与GenBank中收录的CYVCV的CP基因核苷酸和氨基酸序列相似度在97.1%~99.6%和95.5%~99.8%之间,与同为柑橘属的2种环斑病毒(ICRSV-K1和ICRSV-PU) CP基因的核苷酸序列和氨基酸序列相似性在74.0%~71.1%之间.与α线性科的其他病毒相似度均低于40%.在系统进化树中,系统发育树将CYVCV的CP分为3个类群,寻乌县温州蜜柑的CYVCV的CP蛋白与湖南甜橙和重庆尤里卡柠檬分离物CP蛋白聚成一簇,表明它们之间亲缘关系更近.本研究结果表明CYVCV的CP基因具有一定的分子差异,但变异比较保守,各地不同宿主间CYVCV亲缘性较高,这为进一步检测应用打下基础.

关 键 词:柑橘黄化脉明病毒  外壳蛋白基因  序列分析

Cloning and Sequence Analysis in CYVCV CP Gene of Satsuma Mandarin(Citrus unshiu)
Zhang Xiaoyuan,Yang Jie,Hu Wenjuan,Wu Qiaoling,Li Xingtao,Tong Xiaonan.Cloning and Sequence Analysis in CYVCV CP Gene of Satsuma Mandarin(Citrus unshiu)[J].Molecular Plant Breeding,2021,19(21):7048-7054.
Authors:Zhang Xiaoyuan  Yang Jie  Hu Wenjuan  Wu Qiaoling  Li Xingtao  Tong Xiaonan
Abstract:
Keywords:
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