| 番茄SBP基因家族的全基因组鉴定、结构特征及表达分析 |
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| 引用本文： | 万红建,袁伟,俞锞,刘云飞,李志邈,叶青静,王荣青,阮美颖,周国治,姚祝平,杨悦俭.番茄SBP基因家族的全基因组鉴定、结构特征及表达分析[J].分子植物育种,2013(3):299-306. |
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| 作者姓名： | 万红建 袁伟 俞锞 刘云飞 李志邈 叶青静 王荣青 阮美颖 周国治 姚祝平 杨悦俭 |
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| 作者单位： | 浙江省农业科学院蔬菜研究所 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31071800);浙江省自然科学基金(LQ12C150020);浙江省农业新品种选育重大科技专项(2012C12903);国家大宗蔬菜产业技术体系(CARS-25-G-16);浙江省公益技术研究农业项目(2011C22007)共同资助 |
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| 摘 要： | SBP基因家族是植物中一类特有的转录因子家族,广泛参与植物的生长发育以及各种生理生化反应的信号传导。为了揭示番茄SBP基因家族的功能,本研究利用全基因组信息鉴定番茄SBP转录因子家族,分析其结构特征,系统发育关系以及表达模式。结果表明,番茄全基因组共编码17个SBP转录因子成员,分布在8条染色体上;系统发育关系表明SBP基因家族的结构特征变异发生在番茄、拟南芥和水稻分化之前;且它们在番茄、拟南芥和水稻中按照物种特异性的方式进行了扩张。不同芯片分析发现,SlSBP03基因在番茄叶片、子叶和下胚轴中表达量较高,SlSBP13基因果肉中表达量较高,这两个基因在果皮和根中表达量都较低;在大多数非生物胁迫处理条件下,SlSBP11、SlSBP13和SlSBP16的表达量均较低;而SlSBP01基因在干旱和热处理条件下有较高的表达量。
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| 关 键 词： | 番茄 SBP基因家族 生物信息学 水稻 拟南芥 |
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