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| 甜杨抗冻转录因子ICE1基因的in silico克隆及其分析 | |
| 引用本文： | 林元震,张志毅,刘纯鑫,郭海,朱保庆,陈晓阳.甜杨抗冻转录因子ICE1基因的in silico克隆及其分析[J].分子植物育种,2007,5(3):424-430. |
| 作者姓名： | 林元震 张志毅 刘纯鑫 郭海 朱保庆 陈晓阳 |
| 作者单位： | 1. 华南农业大学林学院,广州,510642;北京林业大学林木花卉遗传育种教育部重点实验室,北京,100083 2. 北京林业大学林木花卉遗传育种教育部重点实验室,北京,100083 3. 华南农业大学林学院,广州,510642 4. 水利部水土保持植物中心,北京,100038 |
| 摘 要： | ICEl基因编码类似MYC的bHLH转录因子,可特异地结合到CBF3启动子的MYC作用元件并诱导CBF/DREB1下游基因的转录表达.本文采用电子克隆的方法,以拟南芥ICE1蛋白序列为信息探针,利用杨树EST数据库和毛果杨基因组序列拼接的结果,设计引物并通过RT-PCR从甜杨克隆了杨树的第一个ICE1基因.其cDNA长1 706 bp,含有完整的开放阅读框,可编码543个氨基酸的MYC类蛋白.编码蛋白序列含有bHLH区,核定位信号(NLS)区,富S区和转膜区各1个.Blast分析表明,cDNA序列及其推导的氨基酸序列均与拟南芥和芥菜的ICE1存在着较高的同源性,说明所获得的cDNA可能是甜杨ICE1基因(PsICE1,DQ481236).通过网络服务器平台进行PsICE1的功能预测,结果显示PsICE1含有bHLH保守功能域,具有多个磷酸化位点和跨膜区域.另外,ICE1的电子表达谱分析结果发现,ICE1几乎可在植物中整株表达,在多种组织和不同发育过程均表达,这也在一定程度上说明了ICE1是组成型表达,以及ICE1可能在植物的生长发育中也起着重要作用. |
| 关 键 词： | PsICE1 in silico克隆 甜杨 转录因子 抗冻性 |
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