‘玉铃铛’枣叶绿体基因组特征及密码子偏性

为探究‘玉铃铛’枣叶绿体基因组密码子的使用模式，本研究利用Illumina NovaSeq平台进行测序并组装，获得其叶绿体全基因组序列；利用CodonW 1.4.2、CUSP、SPSS、MISA v1.0等软件分析其密码子偏好性。结果表明，‘玉铃铛’枣叶绿体基因组大小为161 720 bp，注释共得到131个基因，包括86个蛋白编码基因，37个tRNA基因和8个rRNA基因；密码子的第三位的GC含量为28.82%，有效密码子数范围为33.72～59.39,RSCU>1的密码子30个，高表达优越密码子27个，对比得到最优密码子9个，且均已A/U结尾；密码子偏性分析均表明，‘玉铃铛’枣叶绿体基因组使用密码子的偏性受选择影响更大。本研究对叶绿体基因组密码子优化和鼠李科系统进化的相关研究提供重要参考。