甜瓜CmRDR基因家族的鉴定及其对CGMMV侵染的表达分析

RNA依赖性RNA聚合酶(RDRs)是RNA沉默途径中一类重要的蛋白，能够以单链核糖核酸(ssRNA)为模板合成双链核糖核酸(dsRNAs)，启动新一轮的RNA沉默。众所周知，RDR基因在植物抵御病毒侵染中发挥重要的作用，而甜瓜作为一种易受到病害侵染的经济作物，其RDR基因的鉴定尚未见报道。因此，本研究利用生物信息学手段，在全基因组水平对甜瓜RDR基因进行了鉴定，分析其序列特征、亚细胞定位、进化关系和启动子上的逆境和激素响应元件。此外，利用RT-qPCR对甜瓜CmRDR基因的表达特征进行了分析，结果发现，接种黄瓜绿斑驳花叶病毒(CGMMV)后，大部分甜瓜CmRDR基因的表达显著下调。本研究首次鉴定了甜瓜RDRs家族基因的特性，初步揭示了CmRDR基因在CGMMV病毒响应中的功能，为后期甜瓜抗病育种提供了一定的理论依据。