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谷子(Setaria italica)DNA甲基化修饰相关酶类基因的进化及表达分析
引用本文:赵宸,李博,张雨欣,薛敏敏,王晶晶,王宇昕,王红艳.谷子(Setaria italica)DNA甲基化修饰相关酶类基因的进化及表达分析[J].分子植物育种,2019,17(10):3115-3124.
作者姓名:赵宸  李博  张雨欣  薛敏敏  王晶晶  王宇昕  王红艳
作者单位:辽宁大学生命科学院,植物表观遗传与进化实验室,沈阳,110036;辽宁大学生命科学院,植物表观遗传与进化实验室,沈阳,110036;辽宁大学生命科学院,植物表观遗传与进化实验室,沈阳,110036;辽宁大学生命科学院,植物表观遗传与进化实验室,沈阳,110036;辽宁大学生命科学院,植物表观遗传与进化实验室,沈阳,110036;辽宁大学生命科学院,植物表观遗传与进化实验室,沈阳,110036;辽宁大学生命科学院,植物表观遗传与进化实验室,沈阳,110036
基金项目:辽宁省高等学校优秀人才支持计划;辽宁省自然科学基金指导项目;沈阳市科技局项目;辽宁大学青年科研基金项目
摘    要:为系统研究谷子(Setaria italica)参与DNA甲基化修饰相关酶类的编码基因,本研究以测序品种‘豫谷1’为材料,水稻(Oryza sativa L.) DNA甲基化修饰相关酶类基因作为参考,运用序列比对和系统进化树构建的方法,得到13个参与谷子DNA甲基化修饰相关的酶类基因,这些基因与水稻的相应基因相似度为64%~80%。谷子与水稻中DNA甲基化修饰相关酶类基因在系统进化树上主要分成了三个进化枝,并且同功的DNA甲基化修饰相关酶类基因在分枝上彼此相邻。同时,实时荧光定量PCR筛选出13对在谷子中能成功扩增的引物,并对实时荧光定量PCR的程序进行确立和优化。本研究为深入开展谷子的表观遗传学研究提供了科学依据。

关 键 词:DNA甲基化  基因  实时荧光定量PCR  谷子

Evolution and Expression Analysis of Genes Associated with DNA Methylation Modification of Foxtail Millet(Setaria italica)
Zhao Chen,Li Bo,Zhang Yuxin,Xue Minmin,Wang Jingjing,Wang Yuxin,Wang Hongyan.Evolution and Expression Analysis of Genes Associated with DNA Methylation Modification of Foxtail Millet(Setaria italica)[J].Molecular Plant Breeding,2019,17(10):3115-3124.
Authors:Zhao Chen  Li Bo  Zhang Yuxin  Xue Minmin  Wang Jingjing  Wang Yuxin  Wang Hongyan
Institution:(Laboratory of Plant Epigenetics and Evolution, School of Life Science, Liaoning University, Shenyang, 110036)
Abstract:Zhao Chen;Li Bo;Zhang Yuxin;Xue Minmin;Wang Jingjing;Wang Yuxin;Wang Hongyan(Laboratory of Plant Epigenetics and Evolution, School of Life Science, Liaoning University, Shenyang, 110036)
Keywords:DNA methylation modification  Gene  qRT-PCR  Foxtail millet
本文献已被 维普 万方数据 等数据库收录!
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