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冬瓜SSR-PCR体系优化及引物筛选
引用本文:潘珍珍,吴才君,刘文睿,江彪,谢大森.冬瓜SSR-PCR体系优化及引物筛选[J].分子植物育种,2015(4).
作者姓名:潘珍珍  吴才君  刘文睿  江彪  谢大森
作者单位:1. 江西农业大学,南昌,300045; 广东省农业科学院蔬菜研究所,广州,510640; 广东省蔬菜新技术研究重点实验室,广州,510640
2. 江西农业大学,南昌,300045
3. 广东省农业科学院蔬菜研究所,广州,510640; 广东省蔬菜新技术研究重点实验室,广州,510640
基金项目:广东省自然科学基金项目,广州市产学研协同创新重大专项
摘    要:本研究利用L16(54)正交试验设计研究了影响冬瓜SSR-PCR的五个因子(10×Buffer(含Mg2+),d NTP,DNA,引物,r Taq),研究结果表明Buffer(含Mg2+)和r Taq对PCR影响最明显,最终筛选出最佳反应体系:10×Buffer 2.0μL(1×Buffer),d NTP 2.0μL(200μmol/μL),DNA 0.6μL(6 ng/μL),引物0.4μL(0.2μmol/L)。体系体积为20μL,循环数为35。引物筛选程序为:94℃预变性3 min,94℃变性45 s,58℃~68℃复性30 s,5个循环,每个循环退火温度降2℃,72℃延伸1 min,94℃变性30 s,50℃~58℃复性1 min,8个循环,每个循环退火温度降低1℃,72℃延伸1 min,94℃变性30 s,50℃复性30 s,72℃延伸1 min,共30个循环,72℃延伸7 min。本研究建立了适合冬瓜的SSR反应体系和引物多态性筛选程序。

关 键 词:冬瓜  SSR-PCR  体系优化  引物筛选

SSR-PCR System Optimization and Selection of Primers in Wax Gourd
Pan Zhenzhen,Wu Caijun,Liu Wenrui,Jiang Biao,Xie Dasen.SSR-PCR System Optimization and Selection of Primers in Wax Gourd[J].Molecular Plant Breeding,2015(4).
Authors:Pan Zhenzhen  Wu Caijun  Liu Wenrui  Jiang Biao  Xie Dasen
Abstract:
Keywords:Benincasa hispida Cogn    SSR-PCR  System optimization  Selection of primers
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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