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鸭茅SSR-PCR反应体系优化及引物筛选
引用本文:谢文刚,张新全,彭燕,马啸,曾兵.鸭茅SSR-PCR反应体系优化及引物筛选[J].分子植物育种,2008,6(2):381-386.
作者姓名:谢文刚  张新全  彭燕  马啸  曾兵
作者单位:1. 四川农业大学,雅安,625014
2. 西南大学,重庆,402460
基金项目:国家重点基础研究发展计划(973计划) , 教育部跨世纪优秀人才培养计划
摘    要:应用L16(44)正交设计对影响鸭茅SSR-PCR的主要参数进行优化,建立适于鸭茅的SSR反应体系和扩增程序.在15μL体系中各反应的最适合含量为:50ng模板DNA,240μmol/L dNTP,0.4μmol/L SSR引物,1.0 U Taq DNA聚合酶,1.5μL 10×PCR Buffer,2.5mmol/L MgC12.PCR适宜扩增程序为:94℃预变性4min,94℃变性30 s,52℃复性30 s,72℃延伸1 min,共35个循环,72℃延伸10 min,4℃保存.并对引物最适合退火温度进行优化,最终确定引物退火温度为48~52℃.同时选用100对鸭茅引物对4份材料进行扩增,筛选出条带清晰,多态性好的引物30对.用于鸭茅SSR标记的进一步研究.

关 键 词:鸭茅  SSR-PCR  体系优化  引物筛选  鸭茅  反应体系优化  引物筛选  Primer  Selection  System  Reaction  研究  多态性  材料  退火温度  保存  循环  延伸  预变性  Buffer  聚合酶  dNTP  模板  含量  扩增程序

Optimization of SSR-PCR Reaction System in Dactylis glomerata and SSR Primer Selection
Xie Wengang,Zhang Xinquan,Peng Yan,Ma Xiao,Zeng Bing.Optimization of SSR-PCR Reaction System in Dactylis glomerata and SSR Primer Selection[J].Molecular Plant Breeding,2008,6(2):381-386.
Authors:Xie Wengang  Zhang Xinquan  Peng Yan  Ma Xiao  Zeng Bing
Institution:Xie Wengang 1 Zhang Xinquan 1 Peng Yan 1 Ma Xiao 1 Zeng Bing 2 1 Sichuan Agricultural University,Yaan,625014,2 Southwest University,Chongqing,402460
Abstract:
Keywords:Dactylis glomerata  SSR-PCR  Optimization of system  Selection of primers  
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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