| 广藿香法呢基焦磷酸合成酶基因(FPS)的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 张贵翔,吴友根,陈赫,于靖,杨东梅,张军锋,杨豫章.广藿香法呢基焦磷酸合成酶基因(FPS)的克隆及生物信息学分析[J].分子植物育种,2019,17(7):2163-2170. |
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| 作者姓名： | 张贵翔 吴友根 陈赫 于靖 杨东梅 张军锋 杨豫章 |
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| 作者单位： | 海南大学热带农林学院,海口,570228;海南大学热带农林学院,海口,570228;海南大学热带农林学院,海口,570228;海南大学热带农林学院,海口,570228;海南大学热带农林学院,海口,570228;海南大学热带农林学院,海口,570228;海南大学热带农林学院,海口,570228 |
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| 基金项目： | 海南省重点研发计划项目;国家自然科学基金;国家自然科学基金;海南省创新科研课题 |
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| 摘 要： | 为进一步阐明广藿香(Pogostemon cablin (Blanco) Benth.)中百秋李醇(Patchouli alcohol)生物合成的分子调控机制,本研究采用RT-PCR技术从广藿香叶片中克隆得到法呢基焦磷酸合成酶(farnesyl diphosphate synthase) FPS基因,并通过qRT-PCR技术分析FPS基因在广藿香幼苗期(扦插后60 d)与成熟期(扦插后240 d)叶片中的相对表达量。对克隆得到的广藿香FPS基因进行生物信息学分析,序列片段长为1 177 bp,其中包含1个长度为1 050 bp的开放阅读框,编码由349个氨基酸残基构成的蛋白质,与其它已知FPS氨基酸序列的唇形科植物一致性高达93.10%,与已知的米团花(Leucosceptrum canum Smith) FPS蛋白亲缘关系最近。预测FPS蛋白质分子质量约为40.09 kD,理论等电点(pI)为5.34,推测其为亲水性蛋白,无跨膜区且不含信号肽,属于类异戊二烯生物合成家族。qRT-PCR结果表明FPS基因在成熟期叶片中表达量高于幼苗期,与转录组数据分析结果一致。本研究结果为进一步研究FPS基因在广藿香中的应用,探究广藿香中百秋李醇生物合成途径中关键酶的表达模式及通过调控百秋李醇生物合成提高广藿香挥发油中有效成分含量提供了理论依据。
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| 关 键 词： | 广藿香 法呢基焦磷酸合成酶 百秋李醇 基因克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of Farnesyl Diphosphate Synthase(FPS) Gene in Pogostemon cablin |
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| Zhang Guixiang,Wu Yougen,Chen He,Yu Jing,Yang Dongmei,Zhang Junfeng,Yang Yuzhang.Cloning and Bioinformatics Analysis of Farnesyl Diphosphate Synthase(FPS) Gene in Pogostemon cablin[J].Molecular Plant Breeding,2019,17(7):2163-2170. |
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| Authors: | Zhang Guixiang Wu Yougen Chen He Yu Jing Yang Dongmei Zhang Junfeng Yang Yuzhang |
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| Institution: | (College of Tropical Agriculture and Forestry, Hainan University, Haikou, 570228) |
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| Abstract: | Zhang Guixiang;Wu Yougen;Chen He;Yu Jing;Yang Dongmei;Zhang Junfeng;Yang Yuzhang(College of Tropical Agriculture and Forestry, Hainan University, Haikou, 570228) |
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| Keywords: | Pogostemon cablin Famesyl diphosphate synthase Patchouli alcohol Gene cloning Bioinformatics analysis |
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