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基于SRAP标记的哈尼梯田红米遗传多样性及群体结构分析
引用本文:马孟莉,周晓梅,郑云,张婷婷,张晓倩,卢丙越.基于SRAP标记的哈尼梯田红米遗传多样性及群体结构分析[J].分子植物育种,2019,17(7):2231-2237.
作者姓名:马孟莉  周晓梅  郑云  张婷婷  张晓倩  卢丙越
作者单位:红河学院生命科学与技术学院,云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室,蒙自,661100;红河学院生命科学与技术学院,云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室,蒙自,661100;红河学院生命科学与技术学院,云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室,蒙自,661100;红河学院生命科学与技术学院,云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室,蒙自,661100;红河学院生命科学与技术学院,云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室,蒙自,661100;红河学院生命科学与技术学院,云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室,蒙自,661100
基金项目:云南省应用基础研究计划项目;云南省教育厅科学研究基金项目;红河学院中青年学术骨干培养计划项目
摘    要:著名的哈尼梯田核心区位于云南省元阳县,至今仍以种植水稻地方品种为主,梯田红米是其中的主要类型。本研究利用筛选的20对SRAP标记分析60份哈尼梯田红米品种的遗传多样性和群体结构。20对SRAP标记共扩增出182个条带,其中165个具有多态性,多态性比率达90.66%,平均每对引物可扩增9.10个条带;观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样度(H)和Shannon信息指数(I)分别为1.907、1.404、0.239和0.366,表明云南哈尼梯田水稻红米品种具有较丰富的遗传多样性。聚类分析和主成分分析均将60份红米品种分为两大类,即57个籼稻品种聚为第一类,3个粳稻品种聚为第二类,表明哈尼梯田红米以籼稻为主,在籼稻亚群中有部分品种存在遗传分化现象,这一结果与STRUCTURE软件分析的群体结构类型一致。本研究为哈尼梯田红米资源的保护和利用提供了科学依据。

关 键 词:哈尼梯田  红米  遗传多样性  群体结构

Genetic Diversity and Population Structure Analysis of Red Rice from Hani Terraced Fields Based on SRAP Markers
Ma Mengli,Zhou Xiaomei,Zheng Yun,Zhang Tingting,Zhang Xiaoqian,Lu Bingyue.Genetic Diversity and Population Structure Analysis of Red Rice from Hani Terraced Fields Based on SRAP Markers[J].Molecular Plant Breeding,2019,17(7):2231-2237.
Authors:Ma Mengli  Zhou Xiaomei  Zheng Yun  Zhang Tingting  Zhang Xiaoqian  Lu Bingyue
Institution:(Key Laboratory of Crop High Quality and Efficient Cultivation and Security Control of College in Yunnan Province, College of Life Science and Technology,Honghe University, Mengzi, 661100)
Abstract:Ma Mengli;Zhou Xiaomei;Zheng Yun;Zhang Tingting;Zhang Xiaoqian;Lu Bingyue(Key Laboratory of Crop High Quality and Efficient Cultivation and Security Control of College in Yunnan Province, College of Life Science and Technology,Honghe University, Mengzi, 661100)
Keywords:Hani terraces fields  Red rice  Genetic diversity  Population structure
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