小麦条锈菌看家基因SNP引物的开发及多态性位点研究 |
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引用本文: | 李明菊,Md.Ashraful Alam,李昊星,程加省,丁明亮.小麦条锈菌看家基因SNP引物的开发及多态性位点研究[J].分子植物育种,2018(5). |
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作者姓名: | 李明菊 Md.Ashraful Alam 李昊星 程加省 丁明亮 |
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作者单位: | 云南省农业科学院农业环境资源研究所;孟加拉国农业研究所小麦研究中心;华中农业大学生命科学技术学院;云南省农业科学院粮食作物研究所 |
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摘 要: | 利用NCBI数据库进行小麦条锈菌看家基因SNP引物开发,从NCBI搜索到15个基因的序列,利用Primer Premier 5.0软件设计了22对引物,利用其进行条锈菌DNA的PCR扩增、测序,并与标准序列比对,从而筛选出SNP引物。在候选基因中,柠檬酸盐合酶(Cs)、热休克蛋白hsp90(Hsp)、泛素活化酶E1(Uba)及泛素结合酶E2(Ubc)4个基因的5对SNP引物表现多态性,能检测到条锈菌SNP位点依次为4、6~7、4和7个,均为系统发生信息位点,并摸索出优化的PCR反应体系及条件。利用开发的引物研究条锈菌群体结构,可揭示病原菌起源、进化、传播,为病害治理提供依据。
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