基于SSR标记的川西南泡核桃良种DNA指纹图谱构建及聚类分析 |
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引用本文: | 周于波,朱鹏,龚伟,王景燕,闫思宇,吴开志,吴春艳,李海平,龚毅红,段琼.基于SSR标记的川西南泡核桃良种DNA指纹图谱构建及聚类分析[J].分子植物育种,2018(17). |
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作者姓名: | 周于波 朱鹏 龚伟 王景燕 闫思宇 吴开志 吴春艳 李海平 龚毅红 段琼 |
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作者单位: | 四川农业大学林学院林业生态工程四川省重点实验室;四川省林木种苗站 |
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摘 要: | 以川西南11个泡核桃优良品种资源为材料,利用SSR荧光标记技术进行了DNA指纹图谱构建和遗传关系分析。11对SSR荧光引物在11个泡核桃品种中共检测到59个等位基因,每个SSR位点有3~8个等位基因,平均为5.364个,有较好的多态性。期望杂合度(He)、香农信息指数(I)和多态信息含量(PIC)、变幅分别为0.579~0.851、0.993~1.972和0.490~0.833;均值分别为0.692、1.379和0.642。筛选出4对SSR引物wga004、wga032、wga070、zmz05为核心引物构建了各品种的指纹图谱。聚类分析中,11个泡核桃品种间遗传相似系数在0.525~0.932之间。说明11个泡核桃品种间遗传多样性较丰富,亲缘关系与选育的地理来源存在一定的相关性,地域上基因交流广泛,遗传背景复杂。
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