12个辣椒microRNA的靶标预测及表达分析 |
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引用本文: | 孟纯阳,魏小春,赵艳艳,原玉香,杨双娟,王志勇,张晓伟,郑直,姚秋菊,张强.12个辣椒microRNA的靶标预测及表达分析[J].分子植物育种,2018(12). |
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作者姓名: | 孟纯阳 魏小春 赵艳艳 原玉香 杨双娟 王志勇 张晓伟 郑直 姚秋菊 张强 |
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作者单位: | 河南省农业科学院园艺研究所;郑州大学生命科学学院生物工程系 |
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摘 要: | 为了探索12个辣椒microRNA的时空表达及胁迫响应。根据辣椒中已鉴定和注释的microRNA信息,进行靶标预测和时空表达分析。靶标除转录因子外,还有ABC transporter、WD40和锌指结构等。辣椒中miRNA表达具有组织特异性,并且miRNA在果实发育中也起作用。同时,对辣椒进行脱落酸、茉莉酸甲酯、高温、低温、盐和辣椒疫病病原菌处理。采用实时荧光定量PCR检测12个miRNA在不同处理下的表达情况。结果发现micro RNA对胁迫有响应,对胁迫呈现出显著性表达差异,miR4414b受疫病胁迫上调表达,miR167在脱落酸胁迫下下调表达,miR396d经脱落酸、茉莉酸甲酯和疫病诱导后,显著上调表达。miR156在高温和低温胁迫下下调,靶标转录因子SBP可能上调,适应胁迫反应。但miR156a经NaCl诱导后显著上调表达,可能导致靶标下调表达。miR171c经脱落酸、茉莉酸甲酯和疫病处理显著下调,靶标GRAS基因可能上调抵抗胁迫,本研究对辣椒中miRNA的进一步研究提供帮助。
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