茄子SmWRKY1转录因子基因克隆及序列分析

克隆茄子转录因子SmWRKY1基因，对其序列进行分析，为SmWRKY1基因在茄子抗逆分子育种的应用中提供理论依据。以茄子幼苗为试材，依据GenBank上已提交的番茄、甜椒、烟草的WRKY基因序列设计引物，提取总RNA利用RT-PCR方法扩增得到基因片段，克隆、测序并通过NCBI在线和DNAMAN等软件对其核酸及氨基酸序列进行分析。同源克隆得到SmWRKY1，核酸序列930 bp，翻译为310个氨基酸组成的蛋白序列，其中Ser和Thr量最多，分别占总氨基酸数的12.0%和11.0%。NCBI检索SmWRKY1属于WRKY基因超家族，第114至120个氨基酸含有WRKY保守结构域“WRKYGQK”，其锌指结构为C2H2型，初步证实SmWRKY1属于第二大类WRKY转录因子。DNAMAN构建茄子SmWRKY1与不同植物WRKY蛋白的系统发育树，表明茄子WRKY1与番茄中的WRKY1蛋白亲缘关系最近，同源性达96%。WRKY基因在植物耐逆性的研究中有着重要的作用，通过克隆出SmWRKY1基因片段，为进一步克隆其全长、研究其功能做前期准备，为分子育种、培育茄子耐逆性新品种奠定了一定的基础。