| 哈茨木霉Tr1菌株分泌蛋白及Peptaibols合成酶的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 许勇,戴陈伟,李 静,蔡标,张爽,童琳,叶红.哈茨木霉Tr1菌株分泌蛋白及Peptaibols合成酶的生物信息学分析[J].中国农学通报,2018,34(23):46-52. |
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| 作者姓名： | 许勇 戴陈伟 李 静 蔡标 张爽 童琳 叶红 |
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| 作者单位： | 安徽省医学科学研究院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金“鸡Ii 载体介导抗原靶向进入MHCI交叉递呈的作用机理”(31372417)；安徽省“十三五”医疗卫生重点专科“病原微生物 实验室”（皖卫科教[2017]30 号）；2018 年度安徽省卫生计生委科研计划项目“虫荧光素酶的定向进化研究”(2018YK006)；安徽省卫生计生委中医药 科研课题“皖贝母内生真菌分离与鉴定”(2014zy46)。 |
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| 摘 要： | 研究旨在应用生物信息学方法分析生防菌哈茨木霉的分泌蛋白及Peptaibols合成酶。本研究以哈茨木霉Tr1菌株的11264条假定蛋白质序列为对象,利用Signal P、Protparam和Swissmodel等生物信息学工具预测出分泌蛋白,分析其信号肽特征,从中筛选可能与其生防机制有直接联系的分泌蛋白和Peptaibols合成酶,并对这些蛋白质的性质和结构功能进行分析。结果表明:哈茨木霉Tr1菌株含有403个分泌蛋白,其中假定蛋白质PNP53160和PNP56908可能起到纤维素酶和几丁质酶的作用。分泌蛋白的信号肽的中间区域富含亮氨酸和丙氨酸,C端属于A-X-A类型。假定蛋白PNP58822中的16862~20750 aa片段可能起到Peptaibols合成酶作用,该蛋白主要包括了乙酰辅酶A合成酶Ⅰ、Taq A的CT结构域和脂肽合成酶亚基Ⅲ等功能区域。本研究应用生物信息学方法分析了403个分泌蛋白及其信号肽特征,筛选出了可能与哈茨木霉生防机制相关的蛋白质,并预测了其性质、结构和功能,为进一步研究哈茨木霉的生防机制提供理论基础。
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| 关 键 词： | 哈茨木霉 分泌蛋白 生物信息学 信号肽 Peptaibols合成酶 |
| 收稿时间： | 2018/4/3 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2018/7/18 0:00:00 |
Secreted Protein and Peptaibols Synthetase of Trichoerma harzianum Tr1: Bioinformatics Analysis |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Trichoerma harzianum secreted protein bioinformatics signal peptide Peptaibols synthetase |
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