| 穿心莲全长转录组测序及特性分析 |
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| 引用本文： | 孙铭阳,徐世强,顾艳,梅瑜,周芳,李静宇,王继华.穿心莲全长转录组测序及特性分析[J].中国农学通报,2021,37(27):82-89. |
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| 作者姓名： | 孙铭阳 徐世强 顾艳 梅瑜 周芳 李静宇 王继华 |
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| 作者单位： | 广东省农业科学院 作物研究所/广东省农作物遗传改良重点实验室,广州 510640 |
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| 基金项目： | 广东省农业科学院作物研究所/广东省农作物遗传改良重点实验室开放研究基金(202101);科技创新战略专项资金(高水平农科院建设)-金颖之星(R2019PY-JX003);广东省重点领域研发计划项目“广藿香等6种岭南中药材新品种培育研究”(2020B020221001);以农产品为单元的广东省现代农业产业技术体系创新团队建设项目(南药产业)(2019KJ148) |
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| 摘 要： | 为从转录水平上解析穿心莲体内主要进行的生物进程及其分子机制,选取生长60天的福建漳州生产用穿心莲苗为材料,利用超长单分子测序技术测得其根、茎和倒三叶的全长转录组初始序列信息。对初始序列进行筛选、去冗余、校正、功能注释和基因结构分析。结果显示,穿心莲基因的功能主要富集于代谢途径、次生代谢产物合成途径及抗生素合成途径。bHLH、bZIP、MYB和WRKY等直接参与次生代谢的转录因子含量位居前10。穿心莲内酯前体合成途径基因出现可变剪切,主要为内含子保留。其中,有1个基因产生了6个可变启动子式的内含子保留mRNA亚型。总之,次生代谢是穿心莲的主要生物活性进程,相关功能基因可通过结合丰富的转录因子和进行高频的可变剪切参与其中。
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| 关 键 词： | 穿心莲 全长转录组测序 次生代谢 转录因子 可变剪切 简单重复序列 |
| 收稿时间： | 2020-12-11 |
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