| 陆地棉低世代群体纤维品质QTL定位及候选基因功能注释 |
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| 引用本文： | 乔文青,严根土,石建斌,王宁,张亚林,许庆华,周红,黄群.陆地棉低世代群体纤维品质QTL定位及候选基因功能注释[J].棉花学报,2019(4):282-296. |
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| 作者姓名： | 乔文青 严根土 石建斌 王宁 张亚林 许庆华 周红 黄群 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室 |
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| 基金项目： | 中国农业科学院科技创新工程国际合作专项(CAAS-XTCX2018020-4);中国农业科学院科技创新工程植棉技术标准化团队;国家现代农业产业技术体系——棉花产业技术体系(CARS-18-05) |
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| 摘 要： | 【目的】通过对纤维品质数量性状位点(Quantitative trait loci,QTLs)定位及其基因功能注释,为分子标记辅助育种提供理论依据。【方法】以2个纤维品质有差异的陆地棉品种(系)中棉所49和396289为亲本构建F2群体,以高密度遗传图谱为基础,对3个环境的F2:3家系做包括细度和成熟度等在内的7个纤维品质性状QTLs定位,利用直系同源基因簇(Clusters of orthologous groups,COG)、基因本体(Gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)等数据库对QTLs做基因功能注释。【结果】获得157个与纤维品质有关的QTLs,分布于20条染色体上,A03、A04、D02、A11和D07等有较多性状的QTLs聚集,可能是控制纤维品质性状的关键染色体。共获得13个稳定QTLs,其中qFL-A03-1和qFin-A11-4在3个环境中重复出现,另有9个QTLs则在2个环境中重复出现。通过COG、GO和KEGG对QTLs进行基因功能注释,共获得4 763个候选基因,3个数据库分别注释到2 416、4 188和2 512个基因,在稳定QTLs中共注释到429个基因,其中一些基因可能与纤维品质关系密切。【结论】利用高通量测序获得的高密度遗传图谱有助于获得较多QTLs,有利于纤维品质相关候选基因的筛选及性状的改良,提高育种效率。
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| 关 键 词： | 陆地棉 纤维品质 QTL定位 基因注释 |
QTL Mapping of Fiber Quality in Low-Generation Upland Cotton Populations and Functional Annotation of Candidate Genes |
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| Qiao Wenqing,Yan Gentu,Shi Jianbin,Wang Ning,Zhang Yalin,Xu Qinghua,Zhou Hong,Huang Qun.QTL Mapping of Fiber Quality in Low-Generation Upland Cotton Populations and Functional Annotation of Candidate Genes[J].Cotton Science,2019(4):282-296. |
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| Authors: | Qiao Wenqing Yan Gentu Shi Jianbin Wang Ning Zhang Yalin Xu Qinghua Zhou Hong Huang Qun |
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| Institution: | (Institute of Cotton Research,Chinese Academy of Agricultural Sciences / State Key Laboratory of Cotton Biology,Anyang,Henan 455000,China) |
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| Abstract: | Qiao Wenqing;Yan Gentu;Shi Jianbin;Wang Ning;Zhang Yalin;Xu Qinghua;Zhou Hong;Huang Qun(Institute of Cotton Research,Chinese Academy of Agricultural Sciences / State Key Laboratory of Cotton Biology,Anyang,Henan 455000,China) |
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| Keywords: | upland cotton fiber quality QTL mapping gene annotation |
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