四倍体棉花GAE基因家族的鉴定及其在棉纤维发育中的表达分析 |
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引用本文: | 张松雨,王敬敬,刘正文,张艳,杨君,马峙英,王省芬.四倍体棉花GAE基因家族的鉴定及其在棉纤维发育中的表达分析[J].棉花学报,2019(3). |
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作者姓名: | 张松雨 王敬敬 刘正文 张艳 杨君 马峙英 王省芬 |
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作者单位: | 河北农业大学/教育部华北作物种质资源重点实验室/河北省作物种质资源重点实验室 |
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摘 要: | 【目的】通过对陆地棉及海岛棉GAE基因家族进行全基因组分析,为深入研究GAE基因家族在棉纤维发育中的功能提供理论依据。【方法】利用生物信息学分析软件,对GAE基因家族进行全基因组鉴定,根据转录组数据分析在纤维发育过程中的表达规律。【结果】陆地棉GhGAE家族包含21个成员,海岛棉GbGAE家族有22个成员,分为3个亚组,多数Gh GAEs和Gb GAEs基因没有内含子,共分布在12条染色体上。GAE氨基酸序列保守基序有4个,保守性较强,且GAE蛋白均定位于高尔基体膜。根据GAEs在陆地棉、海岛棉纤维发育不同时期的表达变化,将其分为纤维起始期高表达、纤维伸长期高表达、次生壁增厚期高表达、全时期低表达4类模式。其中GhGAE01、GhGAE02、Gh GAE11、Gh GAE12在陆地棉中高水平表达,GbGAE01、Gb GAE02、GbGAE11、Gb GAE12在海岛棉中高水平表达,推测这些基因可能在纤维发育过程中发挥着重要作用。【结论】上述结果为研究GAE基因家族在棉纤维发育中的功能提供了参考依据。
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