| 大豆PHD家族蛋白的全基因组鉴定及表达特征分析 |
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| 引用本文： | 杨珺凯,沈阳,才晓溪,邬升杨,李建伟,孙明哲,贾博为,孙晓丽.大豆PHD家族蛋白的全基因组鉴定及表达特征分析[J].作物杂志,2019,35(3):55-165. |
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| 作者姓名： | 杨珺凯 沈阳 才晓溪 邬升杨 李建伟 孙明哲 贾博为 孙晓丽 |
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| 作者单位： | 黑龙江八一农垦大学农学院/作物逆境分子生物学实验室,163319,黑龙江大庆 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金面上项目(31671596);中国博士后科学基金特别资助项目(2017T100253);黑龙江八一农垦大学研究生创新科研项目(YJSCX2017-Y08) |
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| 摘 要： | PHD（Plant Homeodomain Finger）基因家族编码一类锌指转录因子,广泛参与植物的生长发育和逆境应答过程。通过全基因组鉴定获得了95个大豆PHD家族蛋白。通过共线性分析、进化树构建、基因结构和功能结构域鉴定、GO注释分析、不同组织间和非生物胁迫下表达分析等,获得了大豆PHD家族基因复制、家族进化、保守结构域及基因表达等信息。结果表明,大豆PHD基因在家族进化、基因结构和保守结构域上存在较大变异,可能参与Zn 2+结合、DNA结合及表观遗传调控等分子过程,参与调控植物生长发育和逆境应答。这些结果为进一步研究大豆PHD家族在生长发育和逆境应答中的生物学功能提供重要线索。
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| 关 键 词： | 大豆 PHD转录因子 PHD家族分析 表达特征 逆境胁迫 |
| 收稿时间： | 2018-10-30 |
Genome-Wide Identification and Expression Patterns Analysis of the PHD Family Protein in Glycine max |
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| Yang Junkai,Shen Yang,Cai Xiaoxi,Wu Shengyang,Li Jianwei,Sun Mingzhe,Jia Bowei,Sun Xiaoli.Genome-Wide Identification and Expression Patterns Analysis of the PHD Family Protein in Glycine max[J].Crops,2019,35(3):55-165. |
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| Authors: | Yang Junkai Shen Yang Cai Xiaoxi Wu Shengyang Li Jianwei Sun Mingzhe Jia Bowei Sun Xiaoli |
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| Institution: | College of Agronomy, Heilongjiang Bayi Agricultural University/Crop Stress Molecular Biology Laboratory, Daqing 163319, Heilongjiang, China |
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