| 利用斑茅cDNA芯片研究甘蔗受黑穗病菌侵染后基因差异表达 |
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| 引用本文： | 阙友雄,许莉萍,林剑伟,徐景升,张积森,张木清,陈如凯.利用斑茅cDNA芯片研究甘蔗受黑穗病菌侵染后基因差异表达[J].作物学报,2009,35(5):940-945. |
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| 作者姓名： | 阙友雄 许莉萍 林剑伟 徐景升 张积森 张木清 陈如凯 |
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| 作者单位： | 福建农林大学/农业部甘蔗遗传改良重点开放实验室，福建福州350002 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划)，引进国际先进农业科学技术计划(948计划)，国家自然科学基金，福建省科技厅国家科技项目，现代农业产业技术体系建设专项基金 |
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| 摘 要： | 为了解甘蔗抗黑穗病的分子机制，利用斑茅干旱胁迫cDNA芯片检测了甘蔗受黑穗病菌胁迫后的基因差异表达。经杂交，在cDNA芯片的3 860个模板中，有效差异表达(Ratio值≥2.0或≤0.5)的基因为101个，其中上调55个，下调46个。部分基因的定量PCR验证表明，芯片杂交结果可靠。上调表达基因经测序、冗余序列剔除，一共获得36个unique ESTs。已知功能的22个上调表达基因，涉及多条生理代谢途径，如光合作用、离子转运和核酸代谢途径；以及多种分子水平的进程，如基因转录、蛋白质合成与修饰以及细胞信号转导等。另外，还检测到14个未知功能基因。结果表明，甘蔗对黑穗病的抗性具有复杂的机制。本研究为解释甘蔗受黑穗病菌胁迫后的基因差异表达及其网络构建奠定了基础，还可以为今后系统研究甘蔗对生物与非生物胁迫的响应机制提供技术支持。
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| 关 键 词： | 甘蔗 黑穗病菌 斑茅 cDNA芯片 差异表达基因 |
| 收稿时间： | 2008-09-01 |
Application of E.arundinaceus cDNA Microarray in the Study of Differentially Expressed Genes Induced by U. scitaminea |
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| QUE You-Xiong,XU Li-Ping,LIN Jian-Wei,XU Jing-Sheng,ZHANG Ji-Sen,ZHANG Mu-Qing,CHEN Ru-Kai.Application of E.arundinaceus cDNA Microarray in the Study of Differentially Expressed Genes Induced by U. scitaminea[J].Acta Agronomica Sinica,2009,35(5):940-945. |
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| Authors: | QUE You-Xiong XU Li-Ping LIN Jian-Wei XU Jing-Sheng ZHANG Ji-Sen ZHANG Mu-Qing CHEN Ru-Kai |
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| Institution: | Key Lab of Genetic Improvement for Sugarcane，Ministry of Agriculture，Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sugarcane Ustilago scitaminea E arundinaceus cDNA microarray Differentially expressed gene |
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