| 玉米开花期相关的Indeterminate domain(IDD)蛋白家族基因的鉴定 |
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| 引用本文： | 李云富,王静贤,杜艳芳,邹华文,张祖新.玉米开花期相关的Indeterminate domain(IDD)蛋白家族基因的鉴定[J].作物学报,2019,45(4):499-507. |
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| 作者姓名： | 李云富 王静贤 杜艳芳 邹华文 张祖新 |
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| 作者单位： | 华中农业大学/作物遗传改良国家重点实验室;长江大学农学院 |
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| 基金项目： | This study was supported by the National Natural Science Foundation of China(31871628) |
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| 摘 要： | 开花期是影响玉米产量的重要因子之一。Indeterminate1 (ID1)编码玉米Indeterminate domain (IDD)家族蛋白,是玉米开花期的重要调控因子。然而,其他玉米IDD蛋白家族基因及其生物学功能有待深入研究。本文利用生物信息学技术在玉米基因组中鉴定并分离了37个IDD家族基因,记作ZmIDD。表达分析发现这些ZmIDD基因在8个玉米组织中显示出多种表达模式。为进一步探讨ZmIDD基因在调控玉米开花期上的作用,检测了37个ZmIDD在172个自交系中的遗传多样性,发现35个ZmIDD基因在自交系间具有多态性,平均每个基因具有37.8个多态性位点。关联分析鉴定到包含ID1在内的7个ZmIDD基因在多个环境下与开花期性状显著关联。对Zm00001d020683基因2 kb的启动子区和600 bp编码区重测序,共鉴定到64个多态性位点。候选基因关联分析鉴定到2个启动子区的插入缺失(In/Del)位点与开花期显著关联,其中2个位点分别插入3 bp和2 bp的单倍型为一种提早开花的基因型。研究结果为玉米开花期相关基因的分离和利用研究提供了候选基因和选择靶点。
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| 收稿时间： | 2018-11-01 |
Identification of indeterminate domain protein family genes associated with flowering time in maize |
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| Yun-Fu LI,Jing-Xian WANG,Yan-Fang DU,Hua-Wen ZOU,Zu-Xin ZHANG.Identification of indeterminate domain protein family genes associated with flowering time in maize[J].Acta Agronomica Sinica,2019,45(4):499-507. |
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| Authors: | Yun-Fu LI Jing-Xian WANG Yan-Fang DU Hua-Wen ZOU Zu-Xin ZHANG |
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| Institution: | 1.National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement / Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, Hubei, China;2.College of Agronomy, Yangtze University, Jingzhou 434000, Hubei, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | maize (Zea mays L ) flowering time indeterminate domain (IDD) protein association analysis resequencing |
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