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玉米HD-ZIP I亚家族基因鉴定及表达分析
引用本文:梁思维,姜昊梁,翟立红,万小荣,李小琴,蒋锋,孙伟.玉米HD-ZIP I亚家族基因鉴定及表达分析[J].作物学报,2020,46(4):532-543.
作者姓名:梁思维  姜昊梁  翟立红  万小荣  李小琴  蒋锋  孙伟
作者单位:仲恺农业工程学院农业与生物学院;湖北文理学院医学院
基金项目:This study was supported by the National Natural Science Foundation of China(31901565);the National Key Research and Development Program of Guangdong Province(2018B020202013);the Program of the Science and Technology Bureau of Guangdong Province(粤科产学研字[2016]176号)
摘    要:转录因子是植物响应逆境胁迫的重要调节因子,在其整个生长发育过程中发挥着重要的作用。HD-ZIP家族蛋白是植物中特有的一大类转录因子,包含4个亚家族(HD-ZIP I^IV),其中HD-ZIP I亚家族成员主要参与干旱、渗透压等极端环境和ABA及乙烯等激素处理的响应过程。本文采用隐马可夫模型(HMM)在玉米参考基因组中鉴定到17个HD-ZIP I亚家族成员,这些基因不均匀分布于玉米6条染色体上,与水稻的亲缘关系要近于拟南芥。玉米HDZIP I亚家族基因在玉米7种组织中表现出多种表达模式,具有明显的组织表达特异性。另外, HD-ZIP I亚家族基因对高盐、淹水及冷害等不同的逆境胁迫处理呈现出不同的响应模式及响应程度差异。5种不同激素处理后,玉米HD-ZIP I亚家族基因也表现出复杂的响应模式。这些结果为进一步解析玉米HD-ZIP I亚家族基因的生物学功能和作用机理提供了一定的参考价值。

关 键 词:HD-ZIP  I亚家族  逆境胁迫  表达分析  玉米
收稿时间:2019-07-13

Genome-wide identification and expression analysis of HD-ZIP I subfamily genes in maize
LIANG Si-Wei,JIANG Hao-Liang,ZHAI Li-Hong,WAN Xiao-Rong,LI Xiao-Qin,JIANG Feng,SUN Wei.Genome-wide identification and expression analysis of HD-ZIP I subfamily genes in maize[J].Acta Agronomica Sinica,2020,46(4):532-543.
Authors:LIANG Si-Wei  JIANG Hao-Liang  ZHAI Li-Hong  WAN Xiao-Rong  LI Xiao-Qin  JIANG Feng  SUN Wei
Institution:1.College of Agriculture and Biology, Zhongkai University of Agriculture and Engineering, Guangzhou 510225, Guangdong, China;2.Medical College, Hubei University of Arts and Science, Xiangyang 441053, Hubei, China
Abstract:
Keywords:HD-ZIP I subfamily  abiotic stress  expression analysis  maize  
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