| 大肠杆菌K-12中PFL家族基因的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 韦宇拓,杨登峰,黄日波.大肠杆菌K-12中PFL家族基因的生物信息学分析[J].广西农业生物科学,2005,24(1):18-23. |
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| 作者姓名： | 韦宇拓 杨登峰 黄日波 |
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| 作者单位： | 广西大学生命科学与技术学院,广西亚热带生物资源保护利用重点实验室,广西,南宁,530005 |
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| 基金项目： | 国家“8 63”计划资助项目 ( 2 0 0 3AA0 0 1 0 39) |
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| 摘 要： | 从生物信息学角度，利用生物学数据库(GenBank、Swiss-Prot、PDB)和分子生物学分析软件Vector NTI8．0，对大肠杆菌K—12中的多个丙酮酸甲酸裂解酶(pyruvate formate-lyase，PFL)进行序列的比较分析和结构预测，进而分析其活性位点、相关保守位点和特殊结构域及序列的二级结构，为利用理性设计改造丙酮酸甲酸裂解酶提供一定的信息。
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| 关 键 词： | 丙酮酸甲酸裂解酶 生物信息学 序列分析 比对 结构域 |
| 文章编号： | 1008-3464(2005)01-0018-05 |
| 修稿时间： | 2004年4月6日 |
Analysis of PFL family gene in Escherichia coli K-12 from bioinformatics |
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| WEI Yu-tuo,YANG Deng-feng,HUANG Ri-bo.Analysis of PFL family gene in Escherichia coli K-12 from bioinformatics[J].Journal of Guangxi Agricultural and Biological Science,2005,24(1):18-23. |
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| Authors: | WEI Yu-tuo YANG Deng-feng HUANG Ri-bo |
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| Abstract: | Sequence analysis and structure prediction of pyruvate formate-lyase ( PFL) were performed,based on the knowledge of bioinformatics,with the biological databases( Gen Bank,Swiss- Prot,PDB) and software( Vector NTI8.0 ) supported by Internet.The further analysis of active sites,conserved sites,motifs,and secondary structure of PFLs were obtained,which supply the informations forthe rational design to PFL. |
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| Keywords: | pyruvate formate-lyase bioinformatics sequence analysis alignment moti |
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