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高盐极端环境土壤基因组DNA的分离纯化方法研究及基因文库的构建
引用本文:孙栋,唐莉丽,王倩倩,杨冬梅,蒋承建,武波.高盐极端环境土壤基因组DNA的分离纯化方法研究及基因文库的构建[J].广西农业生物科学,2006,25(1):24-29.
作者姓名:孙栋  唐莉丽  王倩倩  杨冬梅  蒋承建  武波
作者单位:广西大学,微生物及植物遗传工程教育部重点实验室,广西亚热带生物资源保护利用重点实验室,广西,南宁,530005
基金项目:国家863计划资助项目(2001AA214141)
摘    要:以钦州市犀牛角镇晒盐池内(盐浓度>25%)的土壤样品为研究对象,对土壤混合基因组DNA的提取和纯化方法进行了深入研究,结果表明,冻融法、十二烷基磺酸钠(SDS)和蛋白酶K联合使用的提取法,能有效提高DNA得率,DNA的产量达到每克土壤样品10~15μg。交联聚乙烯吡咯烷酮(PVPP)、Sephadex G-200树脂以及大量胶回收的使用,可有效纯化DNA,纯化的DNA产量可达每克土壤样品4~6μg,DNA片段大小>30 kb。将纯化的DNA用B amHⅠ部分酶切后构建以pLAFR 3为载体的混合基因组文库,该文库包含15 600个克隆,外源片段DNA平均大小为18 kb。通过DNA序列测定和同源性比较,对从文库中随机挑取的10个克隆进行了序列分析,发现9个外源插入片段包含未知DNA序列。

关 键 词:土壤  DNA提取  DNA纯化  混合基因组DNA文库
文章编号:1008-3464(2006)01-0024-06
修稿时间:2005年4月28日

Evaluation and optimization of DNA extraction and purification from hypersaline environmental samples and construction of metagenomic library
SUN Dong,TANG Li-li,WANG Qian-qian,YANG Dong-mei,JIANG Cheng-jian,WU Bo.Evaluation and optimization of DNA extraction and purification from hypersaline environmental samples and construction of metagenomic library[J].Journal of Guangxi Agricultural and Biological Science,2006,25(1):24-29.
Authors:SUN Dong  TANG Li-li  WANG Qian-qian  YANG Dong-mei  JIANG Cheng-jian  WU Bo
Abstract:
Keywords:soil  DNA extraction  DNA purification  the metagenomic library
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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