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红壤荒草地氨氧化细菌富集液16SrDNA文库的RFLP分析
引用本文:张丽娜,曹慧,崔中利,孙波,李大力,李顺鹏.红壤荒草地氨氧化细菌富集液16SrDNA文库的RFLP分析[J].土壤学报,2006,43(4):635-641.
作者姓名:张丽娜  曹慧  崔中利  孙波  李大力  李顺鹏
作者单位:1. 南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室,南京,210095;南京理工大学化工学院,南京,210094
2. 南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室,南京,210095
3. 南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室,南京,210095;中国科学院南京土壤研究所,南京,210008
4. 中国科学院南京土壤研究所,南京,210008
5. 南京理工大学化工学院,南京,210094
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划);中国科学院知识创新工程项目;中国博士后科学基金
摘    要:分析红壤荒草地富集液中氨氧化细菌的种群组成,选取氨氧化细菌16S rDNA特异性引物序列,利用PCR技术对从富集液中抽提的细菌总DNA进行扩增,并建立了氨氧化细菌特异性的16S rDNA文库。用酶HhaⅠ和RsaⅠ对该文库特异性片段进行了限制性酶切片断长度多态性分析(Restriction fragment lengthpolymorphism,RFLP),随机挑选的35个特异性克隆片段被分成3个不同的RFLP类型,其中优势型占了所有分析克隆子的94%,另两个型各占3%。从每个RFLP类型中挑取一定的转化子进行测序,测序结果经GenBank检索,发现在该富集液体系文库中存在大量亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)细菌序列,由此推测红壤荒草地中存在氨氧化细菌,Nitrosomonas属细菌能在富集条件下成为优势菌。

关 键 词:氨氧化细菌  16S  rDNA基因文库  富集液  红壤
收稿时间:2006-05-26
修稿时间:2006-05-26

RFLP ANALYSIS OF AOB-SPECIFIC 16S rDNA LIBRARY FROM RED SOIL ENRICHMENT CULTURE
Zhang Lin,Cao Hui,Cui Zhongli,Sun Bo,Li Dali and Li Shunpeng.RFLP ANALYSIS OF AOB-SPECIFIC 16S rDNA LIBRARY FROM RED SOIL ENRICHMENT CULTURE[J].Acta Pedologica Sinica,2006,43(4):635-641.
Authors:Zhang Lin  Cao Hui  Cui Zhongli  Sun Bo  Li Dali and Li Shunpeng
Institution:1 Key Laboratory of Microbiological Engineering of Agricultural Environment, MOA , Nanfing Agricultural University, Nanjing 210095, China;2 Institute of Soil Science , Chinese Academy of Sciences , Nanjing 210008, China;3 College of Chemical Engineering, Nanjing University of Science and Technology, Nanjing 210094, China
Abstract:
Keywords:RFLP
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