| 耐辐射奇球菌Deinococcus radiodurans中非编码RNA |
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| 引用本文： | 陈仲中,王梁燕,林军,田兵,华跃进.耐辐射奇球菌Deinococcus radiodurans中非编码RNA[J].核农学报,2006,20(5):383-387. |
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| 作者姓名： | 陈仲中 王梁燕 林军 田兵 华跃进 |
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| 作者单位： | 浙江大学原子核农业研究所/农业部核农学重点开放实验室,浙江,杭州,310029 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973计划);国家自然科学基金;国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | 耐辐射奇球菌(Deinococcus Radiodurans)对电离辐射、紫外线以及强氧化剂等方面具有惊人的抗性。非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)在参与转录调控、RNA的加工与修饰、mRNA的转录、蛋白质的运输与稳定性调节等方面具有非常明显的作用。本文通过概率上下文无关算法(Stochastic ContextFree Grammar,SCFG),对耐辐射奇球菌R1菌株的基因间序列进行相似二级结构预测,结果发现,在耐辐射奇球菌R1基因组的非编码区存在28个非编码RNA家族。其中IRE家族成员最多,其次是Histone3、tRNA和SECIS家族。所发现的DicF与ctRNA_pGA1t、mRNA等家族成员为细菌所特有。与其他生物比较分析结果显示,可以用这些非编码RNA来研究耐辐射奇球菌的生物学功能,并为进一步研究其DNA损伤与修复分子机制提供依据。
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| 关 键 词： | 耐辐射奇球菌 非编码RNA RNA 二级结构 |
| 文章编号： | 1000-8551(2006)05-387-05 |
| 收稿时间： | 2009-12-31 |
| 修稿时间： | 2005年10月20 |
NON-CODING RNA IN Deinococcus radiodurans |
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| CHEN Zhong-zhong,WANG Liang-yan,LIN Jun,TIAN Bing,HUA Yue-jin.NON-CODING RNA IN Deinococcus radiodurans[J].Acta Agriculturae Nucleatae Sinica,2006,20(5):383-387. |
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| Authors: | CHEN Zhong-zhong WANG Liang-yan LIN Jun TIAN Bing HUA Yue-jin |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | RNA |
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