| 森林草莓全基因组WRKY转录因子基因的鉴定与分析 |
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| 引用本文： | 苗立祥,张豫超,杨肖芳,蒋桂华.森林草莓全基因组WRKY转录因子基因的鉴定与分析[J].核农学报,2012,26(8):1124-1131. |
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| 作者姓名： | 苗立祥 张豫超 杨肖芳 蒋桂华 |
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| 作者单位： | 浙江省农业科学院园艺研究所,浙江杭州,310021 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，公益性行业(农业)科研专项 |
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| 摘 要： | WRKY转录因子是一类重要的调控分子,在高等植物中以基因家族的形式存在。本研究以森林草莓基因组数据为材料,利用生物信息学手段对WRKY转录因子进行全基因组鉴定与分析。结果表明,森林草莓至少有56个WRKY转录因子,蛋白序列长度为58～1982个氨基酸;基因组DNA全长1092～14227bp,具1～20个内含子。染色体定位结果表明,7条染色体上均有WRKY转录因子基因的分布,6号染色体上最多(17),1号染色体分布最少(1)。森林草莓WRKY转录因子可分为3大类,Ⅰ类、Ⅱ类和Ⅲ类的数量分别为10、34和12,它们处于进化树的不同分支。除保守的WRKYGQK和常见变异序列WRKYGKK外,新发现WKKYGQK、WRKSYFR等WRKY结构域类型。
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| 关 键 词： | 草莓 WRKY转录因子 全基因组 序列分析 |
GENOME-WIDE IDENTIFICATION AND ANALYSIS OF WRKY TRANSCRIPTION FACTORS IN Fragaria vesca |
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| MIAO Li-xiang,ZHANG Yu-chao,YANG Xiao-fang,JIANG Gui-hua.GENOME-WIDE IDENTIFICATION AND ANALYSIS OF WRKY TRANSCRIPTION FACTORS IN Fragaria vesca[J].Acta Agriculturae Nucleatae Sinica,2012,26(8):1124-1131. |
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| Authors: | MIAO Li-xiang ZHANG Yu-chao YANG Xiao-fang JIANG Gui-hua |
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| Institution: | (Institute of Horticulture,Zhejiang Academy of Agricultural Sciences,Hangzhou,Zhejiang 310021) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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