| 盐藻CDPK基因的克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 张晓琳,柴晓杰,张婷,余祝君,薛飞.盐藻CDPK基因的克隆与生物信息学分析[J].核农学报,2013,27(4). |
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| 作者姓名： | 张晓琳 柴晓杰 张婷 余祝君 薛飞 |
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| 作者单位： | 大连海洋大学/辽宁省海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室/农业部北方海水增养殖重点实验室,辽宁大连,116023 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，辽宁省教育厅科学技术研究项目 |
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| 摘 要： | 为了研究CDPK基因的结构和功能,应用RT-PCR和RACE方法从盐藻Dunaliella salina中克隆得到CDPK基因(GenBank登录号为JQ964113),并对其进行生物信息学分析.结果表明:盐藻CDPK基因的cDNA全长3 052bp.5’-UTR长70bp；开放阅读框长1650bp,编码549个氨基酸；3’-UTR长1 332bp.蛋白表现为弱酸性,且稳定、亲水,二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主,三级结构同源建模成功.亚细胞定位于叶绿体和细胞核中,无跨膜结构域,无信号肽.蛋白序列中存在4个丝氨酸磷酸化位点、4个苏氨酸磷酸化位点和3个酪氨酸磷酸化位点,蛋白激酶结构域在53 ～ 331位氨基酸处,蛋白激酶ATP结合域在59 ～82位氨基酸处,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性域在173 ～ 185位氨基酸处,4个EF-hand钙结合域分别在357 ～ 385、393 ～ 421、429 ～ 457、465 ～ 493位氨基酸处.进化分析结果表明,克隆的CDPK基因与团藻、衣藻、盐藻Dunaliella tertiolecta的CDPK亲缘关系最近.为进一步研究CDPK基因的功能及探究盐藻耐盐机制的信号转导途径奠定了分子基础.
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| 关 键 词： | 盐藻 钙依赖蛋白激酶(CDPKs) cDNA全长 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatic Analysis of CDPK Gene of Dunaliella salina |
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