| 不同单株叶籽银杏DNA甲基化水平与模式的MSAP分析 |
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| 引用本文： | 王聪聪,邢世岩,李际红,王东升,张倩.不同单株叶籽银杏DNA甲基化水平与模式的MSAP分析[J].核农学报,2013,27(4):399-407. |
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| 作者姓名： | 王聪聪 邢世岩 李际红 王东升 张倩 |
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| 作者单位： | 山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室,山东泰安,271018 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，高等学校博士学科点专项科研基金 |
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| 摘 要： | 以叶籽银杏和普通银杏叶片为试材,利用EcoRⅠ和HpaⅡ/MspⅠ双酶切建立适合于叶籽银杏全基因组的甲基化敏感扩增多态性(MSAP)分析体系,在全基因组水平对11株叶籽银杏和1株正常银杏的胞嘧啶甲基化水平和模式进行评估。结果表明,从36对MSAP选扩引物中,选出14对MSAP引物组合,共扩增产生2766条清晰可辨且可重复的DNA条带,产生3种类型的甲基化条带。在全部扩增位点中,检测到叶籽银杏基因组CCGG序列的甲基化比率为26.42%～65.79%,正常银杏总甲基化率达30.79%,不同单株的叶籽银杏平均总甲基化率达38.61%,叶籽银杏甲基化事件的发生频率为11.27%～27.34%。方差分析显示不同单株间DNA甲基化水平差异极显著。主成分分析绘制的主分量散点图与聚类分析结果一致,不同单株的叶籽银杏可分为3大类。
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| 关 键 词： | 叶籽银杏 DNA甲基化 MSAP分析 表观遗传学 |
DNA Methlation Levels and Patterns in Different Ginkgo Biloba L.var.Epiphylla Mak.by Methlation-Sensitive Amplification Polymorphism (MSAP) |
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| WANG Cong-cong,XING Shi-yan,Li Ji-hong WANG Dong-sheng,ZHANG Qian.DNA Methlation Levels and Patterns in Different Ginkgo Biloba L.var.Epiphylla Mak.by Methlation-Sensitive Amplification Polymorphism (MSAP)[J].Acta Agriculturae Nucleatae Sinica,2013,27(4):399-407. |
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| Authors: | WANG Cong-cong XING Shi-yan Li Ji-hong WANG Dong-sheng ZHANG Qian |
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| Institution: | (Key Laboratory of Agricultural Ecology and Environment,College of Forestry, Shandong Agricultural University,Tai’an,Shandong 271018) |
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