| 基于RNA-seq的谷子萌芽期抗旱相关基因挖掘与分析 |
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| 引用本文： | 代小冬,朱灿灿,宋迎辉,王春义,代书桃,秦娜,李君霞. 基于RNA-seq的谷子萌芽期抗旱相关基因挖掘与分析[J]. 核农学报, 2021, 35(8): 1761-1770. DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2021.08.1761 |
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| 作者姓名： | 代小冬 朱灿灿 宋迎辉 王春义 代书桃 秦娜 李君霞 |
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| 作者单位： | 河南省农业科学院粮食作物研究所,河南郑州450002 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(U1504314),国家现代农业产业技术体系专项资金项目(nycytx-CARS-06) |
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| 摘 要： | 为了明确响应干旱胁迫的关键基因,解析谷子抗旱机制,本研究以谷子抗旱品种山西2010和干旱敏感品种K359*M4-1为材料,应用RNA-seq技术对两个品种干旱胁迫前后萌发期种子进行转录组测定。结果表明,在山西2010和K359*M4-1中分别鉴定出2 300个和3 652个差异表达基因(DEG),包括编码类锌诱导的促进因子、类萌发素蛋白、蛋白磷酸化酶、转运蛋白、胚胎发育晚期丰富蛋白(LEA)、转录因子、过氧化物酶等基因。通过对鉴定到的DEG进行GO和KEGG代谢途径富集分析,发现山西2010和K359*M4-1中的DEG分别富集在52个和21个生物学过程。KEGG 富集分析发现,DEG主要富集在淀粉和蔗糖代谢, 植物激素信号转导,光合作用-天线蛋白,苯丙素生物合成,角质、亚氨酸和蜡生物合成,次生代谢物生物合成等途径。本研究结果为挖掘谷子抗旱关键基因、解析谷子抗旱机制奠定了基础。
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| 关 键 词： | 谷子 萌芽期 抗旱性 RNA-seq |
| 收稿时间： | 2020-03-17 |
Identification and Analysis of Drought Related Genes in Foxtail Millet (Setaria italica L.) at Germination Stage Based on Transcriptome Sequencing |
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| DAI Xiaodong,ZHU Cancan,SONG Yinghui,WANG Chunyi,DAI Shutao,QIN Na,LI Junxia. Identification and Analysis of Drought Related Genes in Foxtail Millet (Setaria italica L.) at Germination Stage Based on Transcriptome Sequencing[J]. Acta Agriculturae Nucleatae Sinica, 2021, 35(8): 1761-1770. DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2021.08.1761 |
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| Authors: | DAI Xiaodong ZHU Cancan SONG Yinghui WANG Chunyi DAI Shutao QIN Na LI Junxia |
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| Affiliation: | Cereal Crops Institute, Henan Academy of Agricultural Sciences, Zhengzhou, Henan 450002 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | foxtail millet germination stage drought resistance RNA-seq |
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