| 大口黑鲈PACAP基因SNPs的筛选及其与生长性状的关联分析 |
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| 引用本文： | 刘浩,白俊杰,李胜杰,马冬梅,全迎春.大口黑鲈PACAP基因SNPs的筛选及其与生长性状的关联分析[J].农业生物技术学报,2016(3):390-396. |
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| 作者姓名： | 刘浩 白俊杰 李胜杰 马冬梅 全迎春 |
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| 作者单位： | 1. 中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室,广州510380;上海海洋大学水产与生命学院,上海201306;2. 中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室,广州,510380 |
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| 基金项目： | 国家科技支撑计划(No.2012BAD26B03);国家自然科学基金(No.31201985)和农业部引进国际先进农业科学技术计划(948计划)项目(No.2011-G12) |
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| 摘 要： | 垂体腺苷酸环化激酶多肽(pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide,PACAP)是一种能够促进生长激素、促性腺激素和催乳素分泌的多效激素,属于胰高血糖素/分泌肽家族的成员.为探索PACAP基因多态性对大口黑鲈(icropterus salmoides)生长性状的影响,本研究采用直接测序的方法在PACAP基因上检测到一个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点:A-2282C,基因型检测共发现3种基因型:AA、AC和CC,其基因型频率分别为0.034、0.645和0.321,A等位基因频率为0.356 3,C等位基因频率为0.643 7.随机选取同批繁殖、同塘养殖的327尾大口黑鲈用Snapshot方法进行SNPs位点检测和分型,构建最小二乘分析模型,分析基因型与生长性状的相关性.X2检测结果显示,哈温-平衡常数为0.061 5,即该位点在所检测大口黑鲈群体中基本处于Hardy-Weinberg平衡状态,有效等位基因数(Ne)为1.846 5,期望杂合度(Ho)和观测杂合度(He)分别为0.540 9和0.644 2.方差分析结果显示,AC基因型群体的平均体质量、体高和全长相对于AA基因型群体分别增长了30.6％、10.7％和8.3％,相对于CC基因型群体分别增长了10.5％、4.7％和2.7％;且AC基因型群体在体质量、体高和全长上显著高于AA和CC基因型群体(P＜0.05).另外,虽然AA基因型群体的平均体质量、体高和全长相对于CC基因型群体分别增长了18.1％、5.8％和5.4％,但AA型群体和CC群体在各生长性状上没有显著差异(P＞0.05).该位点可能是影响大口黑鲈生长性状的的主效数量性状核苷酸(quantitative trait nucleotides,QTN)或与之紧密连锁,可作为大口黑鲈选育的候选分子标记.
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| 关 键 词： | 大口黑鲈 垂体腺苷酸环化激酶多肽(PACAP) SNP 生长 |
SNPs Detection of PACAP Gene and Its Association with Growth Traits in Largemouth Bass (Micropterus salmoides) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Largemouth bass Pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide (PACAP) SNP Growth |
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